Descripción
I2D-BIO_2020_012. Presentamos la información relacionada con los eventos de muestreo acústico pasivo depositados en la Colección de Sonidos Ambientales (IAvH-CSA) del Instituto Humboldt, durante los años 2018-2019. Los eventos de muestreo acústico se generaron en el marco de los proyectos Colombia BIO, Santander BIO, Boyacá BIO, Lizama, Riqueza Natural y ocasionales recolectados durante este período de tiempo. En total se integran 44704 eventos de muestreo que corresponden a 1 minuto de grabación automática tomada a una tasa de muestreo de 44.1 kHz y 16 bits de resolución. El esquema de grabación corresponde a 1 minuto de sonidos ambientales cada 5, 10 o 30 minutos durante todo el día, con una duración de 1 a 20 días de muestreo en 79 sitios a lo largo de Colombia. La cobertura geográfica incluye los departamentos de Bolívar, Boyacá, Caquetá, Cundinamarca, Meta, Santander y Sucre. Esta información se colecta en el marco de la metodología de monitoreo con sensores pasivos establecida por el Instituto Humboldt.
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Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2020). Muestreo pasivo con sensores acústicos de la Colección de Sonidos Ambientales del Instituto Humboldt (IAvH-CSA) realizado entre el 2018 y 2019 en Colombia. 44704 eventos. http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=sonidos_iavh-csa
Palabras clave
parques nacionales naturales; reservas regionales; monitoreo acústico pasivo; evento de muestreo
Datos externos
Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos
Muestreo pasivo con sensores acústicos de la Colección de Sonidos Ambientales del Instituto Humboldt (IAvH-CSA) realizado entre el 2018 y 2019 en Colombia | http://ipt.biodiversidad.co/iavh/resource?r=sonidos_iavh-csa utf-8 txt na |
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Cobertura geográfica
Los registros reportados en este manuscrito fueron obtenidos en diferentes ecosistemas de 79 sitios a lo largo de Colombia (Figura 1). En un contexto generalizado, los muestreos se llevaron a cabo en los páramos de Sumapaz, El Valle y Ocetá, en bosque seco de los Montes de María y el cañón medio del Río Chicamocha, las zonas de amortiguación de los Parques Nacionales Naturales Serranía de los Yariguíes y Chingaza (Linares et al., 2020), en la Reserva Natural Los Yátaros, el territorio Muinane del río Yarí y la quebrada Lizama. Esto quiere decir que incluimos datos provenientes de los municipios de San Jacinto y San Juan Nepomuceno en Bolívar, así como Chalán y Colosó en Sucre. También de los municipios de Barrancabermeja, Bolívar, Cimitarra, El Carmen de Chucurí, San Vicente de Chucurí y Santa Bárbara en Santander. Además de los municipios de Arcabuco, Cómbita, Gachantivá, Monguí y Socha en Boyacá. Finalmente, de los municipios de San Juanito en Meta, Cabrera en Cundinamarca y Solano en Caquetá (ingresando por Puerto Santander, Amazonas).
Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [-0,56, -75,364], Latitud Máxima Longitud Máxima [10,029, -72,256] |
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Cobertura temporal
Fecha Inicial / Fecha Final | 2018-02-18 / 2019-12-21 |
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Datos del proyecto
No hay descripción disponible
Título | Colecciones Biológicas del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt |
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Fuentes de Financiación | La financiación provino de los proyectos Boyacá Bio, Santander Bio, Colombia Bio, Riqueza Natural y Ecopetrol-Lizama, así como otros proyectos interinstitucionales desarrollados por los autores. |
Descripción del área de estudio | Comprende varios departamentos de Colombia de acuerdo con la jurisdicción de cada proyecto. |
Descripción del diseño | Fueron obtenidos ejemplares digitales de sonido de 1 minuto de duración, colectados de manera automática por sensores acústicos generados por el proyecto ARBIMON de Sieve Analytics Inc (Deichmann et al., 2017, Herrera-Montes, 2018), en intervalos de 5, 10 o 30 minutos de pausa o no grabación. Los audios fueron depositados en las colecciones biológicas del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, dentro de la Colección de Sonidos Ambientales IAvH-CSA. |
Personas asociadas al proyecto:
Métodos de muestreo
Para este muestreo acústico pasivo usamos grabadoras automáticas ensambladas por el proyecto ARBIMON de Sieve Analytics Inc, que consisten en un celular Motorola MotoG dentro de un estuche de protección y con un micrófono externo acoplado (Deichmann et al., 2017, Herrera-Montes, 2018). Las grabadoras tenían instalada la aplicación Arbimon Touch para Android, que permite escoger diferentes esquemas de grabación. Dependiendo de cada proyecto, escogimos entre tres esquemas de grabación de 1 minuto de audio variando el espaciado entre descansos de 5, 10 o 30 minutos. Cada punto de muestreo se seleccionaba según criterio del investigador en campo, intentando siempre incluir por lo menos de 50 a 100 m de la misma cobertura para captar la huella acústica del hábitat escogido y asumiendo independencia a cada punto. Este tipo de grabadoras, aunque depende de las barreras que el medio le ponga al sonido, pueden captar una semiesfera de ~50 m a la redonda (Campos-Cerqueira & Aide, 2016). Las grabadoras duraron en el campo por períodos de 1 hasta 20 días.
Área de Estudio | El muestreo ocurrió en 79 sitios que abarcan diferentes condiciones ambientales en Colombia. Sin embargo, muchos de los muestreos no fueron simultáneos, pues la instalación de las grabadoras podría considerarse oportunista y dependiente de las salidas al campo y las preguntas de investigación de cada proyecto. A lo largo de 2018 y 2019, fueron instaladas grabadoras con diferentes esquemas de grabación. En algunos sitios las grabadoras alcanzaron a obtener la totalidad esperada por día a partir de los esquemas propuestos. La selección del esquema de grabación (1 minuto cada 5, 10 o 30 minutos) estuvo a cargo del investigador en cada salida, pero al parecer puede verse una tendencia en el muestreo de esquemas muy intensos (1 minuto cada 5 minutos) en ecosistemas altoandinos y un poco más espaciada (1 minuto cada 30 minutos) en zonas bajas. |
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Control de Calidad | Verificamos el funcionamiento de cada grabadora en campo, revisando que la hora y fecha correspondiera al momento de muestreo, así como que tuviera capacidad de batería y memoria. A cada punto de muestreo le asignamos un nombre para poder rastrear cada evento de recolecta de datos. Tres sitios donde la grabadora no fue correctamente instalada (falla en fecha y hora) fueron descartados dentro del proceso de control de calidad. La matriz final obtenida fue verificada por el personal de la Infraestructura Institucional de Datos (I2D) del Instituto Humboldt. |
Descripción de la metodología paso a paso:
- 1. Programación de las grabadoras: siguiendo el protocolo propuesto por Sieve Analytics Inc, desde la aplicación ARBIMON Touch directamente en el celular. Fue confirmado que la batería, fecha y hora del dispositivo correspondieran al evento de muestreo en campo. 2. Asignación del esquema de muestreo: se seleccionó grabar 1 minuto cada 5, 10 o 30 minutos. 3. Instalación de las grabadoras en el lugar destinado para grabar, por una duración de 1 a 20 días. 4. Registro de las coordenadas geográficas y elevación del punto de muestreo utilizando un GPS. 5. Desinstalación de las grabadoras y descarga de los archivos en un computador 6. Almacenamiento en la colección siguiendo los estándares definidos.
Datos de la colección
Nombre de la Colección | Colección de Sonidos Ambientales del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt |
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Identificador de la Colección | IAvH-CSA |
Identificador de la Colección Parental | IAvH |
Métodos de preservación de los ejemplares | Otro |
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Unidades curatoriales | Entre 1 y 40.704 grabaciones WAV y FLAC |
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Referencias bibliográficas
- Aide, T. M., Corrada-Bravo, C., Campos-Cerqueira, M., Milan, C., Vega, G. & Alvarez, R. (2013). Real-time bioacoustics monitoring and automated species identification. PeerJ, 1, e103. https://doi.org/10.7717/peerj.103
- Campos‐Cerqueira, M., & Aide, T. M. (2016). Improving distribution data of threatened species by combining acoustic monitoring and occupancy modelling. Methods in Ecology and Evolution, 7(11), 1340-1348. https://doi.org/10.1111/2041-210X.12599
- Campos-Cerqueira, M., & Aide, T. M. (2017). Changes in the acoustic structure and composition along a tropical elevational gradient. Journal of Ecoacoustics, 1, PNCO7I. https://doi.org/10.22261/JEA.PNCO7I
- Deichmann, J. L., Hernandez-Serna, A., Campos-Cerqueira, M., & Aide, T. M. (2017). Soundscape analysis and acoustic monitoring document impacts of natural gas exploration on biodiversity in a tropical forest. Ecological Indicators, 74, 39-48. https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2016.11.002
- Deichmann, J. L., Acevedo-Charry, O., Barclay, L., Burivalova, Z., Campos-Cerqueira, M., d'Horta, F., Game, E. T., Gottesman, B. L., Hart, P. J., Kalan, A. K., Linke, S., Do Nascimento, L., Pijanowski, B., Staaterman, E., & Aide, T. M. (2018). It's time to listen: there is much to be learned from the sounds of tropical ecosystems. Biotropica, 50(5), 713-718. https://doi.org/10.1111/btp.12593
- Ducrettet, M., Forget, P. M., Ulloa, J. S., Yguel, B., Gaucher, P., Princé, K., ... & Sueur, J. (2020). Monitoring canopy bird activity in disturbed landscapes with automatic recorders: A case study in the tropics. Biological Conservation, 245, 108574. https://doi.org/10.1016/j.biocon.2020.108574
- Furumo, P. R., & Aide, T. M. (2019). Using soundscapes to assess biodiversity in Neotropical oil palm landscapes. Landscape Ecology, 34(4), 911-923. https://doi.org/10.1007/s10980-019-00815-w
- Herrera-Montes, M. I. (2018). Protected Area Zoning as a Strategy to Preserve Natural Soundscapes, Reduce Anthropogenic Noise Intrusion, and Conserve Biodiversity. Tropical Conservation Science, 11, 1940082918804344. https://doi.org/10.1177/1940082918804344
- Kass, J. M., Vilela, B., Aiello-Lammens, M. E., Muscarella, R., Merow, C., & Anderson, R. P. (2017). Wallace: A flexible platform for reproducible modeling of species niches and distributions built for community expansion. Methods in Ecology and Evolution, 9(4), 1151-1156. https://doi.org/10.1111/2041-210X.12945
- Krause, B. (1987). Bioacoustics, habitat ambience in ecological balance. Whole Earth Review, 57 (Winter).
- Linares-Romero, L. G., Acevedo-Charry, O., Avellaneda, F., Cortés-Herrera, O., Cuervo, A. M., Galindo-T, R., Hernández, D., Pérez-Peña, S., Pulido, A. R., Pulido-Santacruz, P., Santana, D., Seeholzer, G. F., Sierra-Buitra, M. S., Soto-Patiño, J., & Laverde, O. (2020). Aves del Parque Nacional Natural Chingaza y zona de amortiguación, Cordillera Oriental de Colombia. Biota Colombiana, 21(1), 117-129. https://doi.org/10.21068/c2020.v21n01a09
- Parker III, T. A. (1991). On the use of tape recorders in avifaunal surveys. The Auk, 108(2), 443-444. https://doi.org/10.1093/auk/108.2.443
- Pérez-Granados, C., Schuchmann, K. L., & Marques, M. I. Vocal behavior of the Undulated Tinamou (Crypturellus undulatus) over an annual cycle in the Brazilian Pantanal: New ecological information. Biotropica, 52(1), 165-171. https://doi.org/10.1111/btp.12742
- Rodríguez-Buriticá, S., Savage, D., Caycedo, P., Acevedo-Charry, O., Isaza, C., Daza, J. M., Almeira, J., Ulloa, J. S., Orozco-Alzate, M., Villamizar, N., Ruiz, J. F., Lopera, A., Oliver, B., Laverde, O. Pijanowski, B., & Red Ecoacústica Colombiana. (2019). Paisajes sonoros de Colombia: La otra dimensión de la biodiversidad. En Reporte de Estado y Tendencia de la biodiversidad continental de Colombia 2018. Ficha 103. Bogotá D. C.: Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. Disponible en http://reporte.humboldt.org.co/biodiversidad/2018/cap1/103/ http://reporte.humboldt.org.co/biodiversidad/2018/cap1/103/
Metadatos adicionales
Propósito | Cada lugar en el planeta tiene una huella acústica particular (Krause, 1987). Sin embargo, muchos lugares en el mundo aún no cuentan con información acústica registrada que permita caracterizar su huella. Similar a otros componentes de la biodiversidad, la colecta de sonidos puede abordarse desde una perspectiva activa y direccional (Parker, 1991), o puede ser integrado en muestreos pasivos con sensores acústicos automatizados que no incluyen interferencia por el observador (Aide et al., 2013; Rodríguez-Buriticá et al., 2019). El muestreo pasivo con sensores acústicos permite obtener datos de señales acústicas de manera efectiva, lo cual es una gran oportunidad para estudiar la biodiversidad tropical (Deichmann et al., 2018; Rodríguez-Buriticá et al., 2019). Un posible enfoque de esta herramienta es medir la huella acústica a partir del análisis de paisajes sonoros, los cuales pueden variar a través de gradientes de elevación (Campos-Cerqueira & Aide, 2017), en respuesta al disturbio (Deichmann et al., 2017) o por tipos de cobertura (Furumo & Aide, 2019). Adicionalmente, los datos obtenidos por muestreo pasivo con sensores acústicos permiten abordar preguntas direccionadas a la actividad acústica de especies en particular (Campos-Cerqueira & Aide, 2016). Entre 2018 y 2019, algunos proyectos del Instituto Humboldt incluyeron eventos de muestreo acústico pasivo para complementar muestreos de biodiversidad. Para esto, algunas veces fueron invitados investigadores de la Colección de Sonidos Ambientales IAvH-CSA, o fue solicitado apoyo a esta colección para poder tener muestras de este tipo dentro de los proyectos particulares. El objetivo de los muestreos fue compilar muestras acústicas de mínimo un día en diferentes lugares de Colombia que incluyen los Andes (Boyacá, Cundinamarca, Meta y Santander), la Amazonia (Caquetá) y el Caribe (Sucre y Bolívar), que contribuyeran al futuro crecimiento de la colección y al enriquecimiento del conocimiento ecoacústico del país. |
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Identificadores alternativos | http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=sonidos_iavh-csa |