Muestreo pasivo con sensores acústicos de la Colección de Sonidos Ambientales del Instituto Humboldt (IAvH-CSA) realizado entre el 2018 y 2019 en Colombia

Tipo de acceso a la información: Libre a nivel interno y externo (Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0)

I2D-BIO_2020_012. Presentamos la información relacionada con los eventos de muestreo acústico pasivo depositados en la Colección de Sonidos Ambientales (IAvH-CSA) del Instituto Humboldt, durante los años 2018-2019. Los eventos de muestreo acústico se generaron en el marco de los proyectos Colombia BIO, Santander BIO, Boyacá BIO, Lizama, Riqueza Natural y ocasionales recolectados durante este período de tiempo. En total se integran 44704 eventos de muestreo que corresponden a 1 minuto de grabación automática tomada a una tasa de muestreo de 44.1 kHz y 16 bits de resolución. El esquema de grabación corresponde a 1 minuto de sonidos ambientales cada 5, 10 o 30 minutos durante todo el día, con una duración de 1 a 20 días de muestreo en 79 sitios a lo largo de Colombia. La cobertura geográfica incluye los departamentos de Bolívar, Boyacá, Caquetá, Cundinamarca, Meta, Santander y Sucre. Esta información se colecta en el marco de la metodología de monitoreo con sensores pasivos establecida por el Instituto Humboldt.

Resumen
Fecha de publicación Jun 19, 2020
Versión 4 (última)
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Registro GBIF No registrado
Palabras Clave
parques nacionales naturales; reservas regionales; monitoreo acústico pasivo; evento de muestreo
Idioma
Idioma de los metadatos Español
Idioma del recurso Español
Enlaces Externos
URL del recursohttp://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=sonidos_iavh-csa
Muestreo pasivo con sensores acústicos de la Colección de Sonidos Ambientales del Instituto Humboldt (IAvH-CSA) realizado entre el 2018 y 2019 en Colombiahttp://ipt.biodiversidad.co/iavh/resource?r=sonidos_iavh-csa utf-8 txt na
Contacto del Recurso
NombreOrlando Acevedo-Charry
PosiciónCurador Colección de Sonidos Ambientales
OrganizaciónInstituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Dirección Carrera 8 # 15-08, Villa de Leyva, Boyacá, COLOMBIA
Contactooacevedo@humboldt.org.co Tel: 3202767
Página Webhttp://www.humboldt.org.co
Creador del Recurso
NombreDaniela Murillo Bedoya
PosiciónInvestigadora
OrganizaciónInstituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Dirección Carrera 8 # 15-08, Villa de Leyva, Boyacá, COLOMBIA
Contactodmurillo@humboldt.org.co Tel: 3202767
Página Webhttp://www.humboldt.org.co
Proveedor de Metadatos
NombreDaniela Murillo-Bedoya
PosiciónInvestigadora
OrganizaciónInstituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Dirección Carrera 8 # 15-08, Villa de Leyva, Boyacá, COLOMBIA
Contactodmurillo@humboldt.org.co Tel: 3202767
Página Webhttp://www.humboldt.org.co
Parte Asociada 1
Nombre Infraestructura Institucional de Datos
OrganizaciónIInstituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Dirección Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá, D.C., Bogotá, D.C., COLOMBIA
Contactoi2d@humboldt.org.co Tel: 3202767
Página Webhttp://www.humboldt.org.co
Rol Custodio de los Datos
Parte Asociada 2
NombreOrlando Acevedo-Charry
PosiciónCurador Colección de Sonidos Ambientales
OrganizaciónInstituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Dirección Carrera 8 # 15-08, Villa de Leyva, Boyacá, COLOMBIA
Contactooacevedo@humboldt.org.co Tel: 3202767
Rol Curador
Parte Asociada 3
NombreDaniela Murillo-Bedoya
PosiciónInvestigadora
OrganizaciónInstituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Dirección Carrera 8 # 15-08, Villa de Leyva, Boyacá, COLOMBIA
Contactodmurillo@humboldt.org.co Tel: 3202767
Rol Autor
Parte Asociada 4
NombreAlexandra Buitrago-Cardona
PosiciónInvestigadora
OrganizaciónInstituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Dirección Carrera 8 # 15-08, Villa de Leyva, Boyacá, COLOMBIA
Contactoabuitrago@humboldt.org.co Tel: 3202767
Rol Proveedor de Contenido
Parte Asociada 5
NombreClaudia A. Medina-Uribe
PosiciónInvestigadora
OrganizaciónInstituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Dirección Carrera 8 # 15-08, Villa de Leyva, Boyacá, COLOMBIA
Contactocmedina@humboldt.org.co Tel: 3202767
Rol Proveedor de Contenido
Parte Asociada 6
NombreAna María Ospina-Larrea
PosiciónInvestigadora
OrganizaciónInstituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Dirección Carrera 8 # 15-08, Villa de Leyva, Boyacá, COLOMBIA
Contactoaospina@humboldt.org.co Tel: 3202767
Rol Proveedor de Contenido
Parte Asociada 7
NombreZuania Colon-Pineiro
PosiciónInvestigadora independiente
OrganizaciónReserva Natural Los Yátaros
Dirección Cll 7 # 10-53, Villa de Leyva, Boyacá, COLOMBIA
Contactozcolonp@gmail.com
Rol Proveedor de Contenido
Parte Asociada 8
NombreJose Manuel Ochoa-Quintero
PosiciónSubdirector de Investigaciones
OrganizaciónInstituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Dirección Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá, D.C., Bogotá, D.C., COLOMBIA
Contactojochoa@humboldt.org.co Tel: 3202767
Rol Proveedor de Contenido
Parte Asociada 9
NombreBibiana Gómez-Valencia
PosiciónInvestigadora
OrganizaciónInstituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Dirección Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá, D.C., Bogotá, D.C., COLOMBIA
Contactobgomezv@humboldt.org.co Tel: 3202767
Rol Proveedor de Contenido
Parte Asociada 10
NombreYenifer Herrera-Varón
PosiciónInvestigadora
OrganizaciónInstituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Dirección Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá, D.C., Bogotá, D.C., COLOMBIA
Contactoyherrera@humboldt.org.co Tel: 3202767
Rol Proveedor de Contenido
Cobertura Geográfica
DescripciónLos registros reportados en este manuscrito fueron obtenidos en diferentes ecosistemas de 79 sitios a lo largo de Colombia (Figura 1). En un contexto generalizado, los muestreos se llevaron a cabo en los páramos de Sumapaz, El Valle y Ocetá, en bosque seco de los Montes de María y el cañón medio del Río Chicamocha, las zonas de amortiguación de los Parques Nacionales Naturales Serranía de los Yariguíes y Chingaza (Linares et al., 2020), en la Reserva Natural Los Yátaros, el territorio Muinane del río Yarí y la quebrada Lizama. Esto quiere decir que incluimos datos provenientes de los municipios de San Jacinto y San Juan Nepomuceno en Bolívar, así como Chalán y Colosó en Sucre. También de los municipios de Barrancabermeja, Bolívar, Cimitarra, El Carmen de Chucurí, San Vicente de Chucurí y Santa Bárbara en Santander. Además de los municipios de Arcabuco, Cómbita, Gachantivá, Monguí y Socha en Boyacá. Finalmente, de los municipios de San Juanito en Meta, Cabrera en Cundinamarca y Solano en Caquetá (ingresando por Puerto Santander, Amazonas).
Coordenadas-0.56, 10.029 / -75.364, -72.256 (Latitud mínima, máxima / Longitud mínima/máxima)
Cobertura Temporal
Fecha inicial / Fecha final2018-02-18 / 2019-12-21
Datos del Proyecto
TítuloColecciones Biológicas del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
(Personal) Nombre Orlando Acevedo-Charry
(Personal) Rol Curador
Fuentes de financiaciónLa financiación provino de los proyectos Boyacá Bio, Santander Bio, Colombia Bio, Riqueza Natural y Ecopetrol-Lizama, así como otros proyectos interinstitucionales desarrollados por los autores.
Descripción del área de estudioComprende varios departamentos de Colombia de acuerdo con la jurisdicción de cada proyecto.
Descripción del proyectoFueron obtenidos ejemplares digitales de sonido de 1 minuto de duración, colectados de manera automática por sensores acústicos generados por el proyecto ARBIMON de Sieve Analytics Inc (Deichmann et al., 2017, Herrera-Montes, 2018), en intervalos de 5, 10 o 30 minutos de pausa o no grabación. Los audios fueron depositados en las colecciones biológicas del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, dentro de la Colección de Sonidos Ambientales IAvH-CSA.
Métodos de Muestreo
Área de estudioEl muestreo ocurrió en 79 sitios que abarcan diferentes condiciones ambientales en Colombia. Sin embargo, muchos de los muestreos no fueron simultáneos, pues la instalación de las grabadoras podría considerarse oportunista y dependiente de las salidas al campo y las preguntas de investigación de cada proyecto. A lo largo de 2018 y 2019, fueron instaladas grabadoras con diferentes esquemas de grabación. En algunos sitios las grabadoras alcanzaron a obtener la totalidad esperada por día a partir de los esquemas propuestos. La selección del esquema de grabación (1 minuto cada 5, 10 o 30 minutos) estuvo a cargo del investigador en cada salida, pero al parecer puede verse una tendencia en el muestreo de esquemas muy intensos (1 minuto cada 5 minutos) en ecosistemas altoandinos y un poco más espaciada (1 minuto cada 30 minutos) en zonas bajas.
Descripción del muestreoPara este muestreo acústico pasivo usamos grabadoras automáticas ensambladas por el proyecto ARBIMON de Sieve Analytics Inc, que consisten en un celular Motorola MotoG dentro de un estuche de protección y con un micrófono externo acoplado (Deichmann et al., 2017, Herrera-Montes, 2018). Las grabadoras tenían instalada la aplicación Arbimon Touch para Android, que permite escoger diferentes esquemas de grabación. Dependiendo de cada proyecto, escogimos entre tres esquemas de grabación de 1 minuto de audio variando el espaciado entre descansos de 5, 10 o 30 minutos. Cada punto de muestreo se seleccionaba según criterio del investigador en campo, intentando siempre incluir por lo menos de 50 a 100 m de la misma cobertura para captar la huella acústica del hábitat escogido y asumiendo independencia a cada punto. Este tipo de grabadoras, aunque depende de las barreras que el medio le ponga al sonido, pueden captar una semiesfera de ~50 m a la redonda (Campos-Cerqueira & Aide, 2016). Las grabadoras duraron en el campo por períodos de 1 hasta 20 días.
Control de calidadVerificamos el funcionamiento de cada grabadora en campo, revisando que la hora y fecha correspondiera al momento de muestreo, así como que tuviera capacidad de batería y memoria. A cada punto de muestreo le asignamos un nombre para poder rastrear cada evento de recolecta de datos. Tres sitios donde la grabadora no fue correctamente instalada (falla en fecha y hora) fueron descartados dentro del proceso de control de calidad. La matriz final obtenida fue verificada por el personal de la Infraestructura Institucional de Datos (I2D) del Instituto Humboldt.
Metodología paso a paso 11. Programación de las grabadoras: siguiendo el protocolo propuesto por Sieve Analytics Inc, desde la aplicación ARBIMON Touch directamente en el celular. Fue confirmado que la batería, fecha y hora del dispositivo correspondieran al evento de muestreo en campo. 2. Asignación del esquema de muestreo: se seleccionó grabar 1 minuto cada 5, 10 o 30 minutos. 3. Instalación de las grabadoras en el lugar destinado para grabar, por una duración de 1 a 20 días. 4. Registro de las coordenadas geográficas y elevación del punto de muestreo utilizando un GPS. 5. Desinstalación de las grabadoras y descarga de los archivos en un computador 6. Almacenamiento en la colección siguiendo los estándares definidos.
Referencias
Identificador de la citación para este recurso http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=sonidos_iavh-csa
Cómo citar este recurso Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2020). Muestreo pasivo con sensores acústicos de la Colección de Sonidos Ambientales del Instituto Humboldt (IAvH-CSA) realizado entre el 2018 y 2019 en Colombia. 44704 eventos. http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=sonidos_iavh-csa
Identificador de la referencia https://doi.org/10.7717/peerj.103
Referencia Aide, T. M., Corrada-Bravo, C., Campos-Cerqueira, M., Milan, C., Vega, G. & Alvarez, R. (2013). Real-time bioacoustics monitoring and automated species identification. PeerJ, 1, e103.
Identificador de la referencia https://doi.org/10.1111/2041-210X.12599
Referencia Campos‐Cerqueira, M., & Aide, T. M. (2016). Improving distribution data of threatened species by combining acoustic monitoring and occupancy modelling. Methods in Ecology and Evolution, 7(11), 1340-1348.
Identificador de la referencia https://doi.org/10.22261/JEA.PNCO7I
Referencia Campos-Cerqueira, M., & Aide, T. M. (2017). Changes in the acoustic structure and composition along a tropical elevational gradient. Journal of Ecoacoustics, 1, PNCO7I.
Identificador de la referencia https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2016.11.002
Referencia Deichmann, J. L., Hernandez-Serna, A., Campos-Cerqueira, M., & Aide, T. M. (2017). Soundscape analysis and acoustic monitoring document impacts of natural gas exploration on biodiversity in a tropical forest. Ecological Indicators, 74, 39-48.
Identificador de la referencia https://doi.org/10.1111/btp.12593
Referencia Deichmann, J. L., Acevedo-Charry, O., Barclay, L., Burivalova, Z., Campos-Cerqueira, M., d'Horta, F., Game, E. T., Gottesman, B. L., Hart, P. J., Kalan, A. K., Linke, S., Do Nascimento, L., Pijanowski, B., Staaterman, E., & Aide, T. M. (2018). It's time to listen: there is much to be learned from the sounds of tropical ecosystems. Biotropica, 50(5), 713-718.
Identificador de la referencia https://doi.org/10.1016/j.biocon.2020.108574
Referencia Ducrettet, M., Forget, P. M., Ulloa, J. S., Yguel, B., Gaucher, P., Princé, K., ... & Sueur, J. (2020). Monitoring canopy bird activity in disturbed landscapes with automatic recorders: A case study in the tropics. Biological Conservation, 245, 108574.
Identificador de la referencia https://doi.org/10.1007/s10980-019-00815-w
Referencia Furumo, P. R., & Aide, T. M. (2019). Using soundscapes to assess biodiversity in Neotropical oil palm landscapes. Landscape Ecology, 34(4), 911-923.
Identificador de la referencia https://doi.org/10.1177/1940082918804344
Referencia Herrera-Montes, M. I. (2018). Protected Area Zoning as a Strategy to Preserve Natural Soundscapes, Reduce Anthropogenic Noise Intrusion, and Conserve Biodiversity. Tropical Conservation Science, 11, 1940082918804344.
Identificador de la referencia https://doi.org/10.1111/2041-210X.12945
Referencia Kass, J. M., Vilela, B., Aiello-Lammens, M. E., Muscarella, R., Merow, C., & Anderson, R. P. (2017). Wallace: A flexible platform for reproducible modeling of species niches and distributions built for community expansion. Methods in Ecology and Evolution, 9(4), 1151-1156.
Referencia Krause, B. (1987). Bioacoustics, habitat ambience in ecological balance. Whole Earth Review, 57 (Winter).
Identificador de la referencia https://doi.org/10.21068/c2020.v21n01a09
Referencia Linares-Romero, L. G., Acevedo-Charry, O., Avellaneda, F., Cortés-Herrera, O., Cuervo, A. M., Galindo-T, R., Hernández, D., Pérez-Peña, S., Pulido, A. R., Pulido-Santacruz, P., Santana, D., Seeholzer, G. F., Sierra-Buitra, M. S., Soto-Patiño, J., & Laverde, O. (2020). Aves del Parque Nacional Natural Chingaza y zona de amortiguación, Cordillera Oriental de Colombia. Biota Colombiana, 21(1), 117-129.
Identificador de la referencia https://doi.org/10.1093/auk/108.2.443
Referencia Parker III, T. A. (1991). On the use of tape recorders in avifaunal surveys. The Auk, 108(2), 443-444.
Identificador de la referencia https://doi.org/10.1111/btp.12742
Referencia Pérez-Granados, C., Schuchmann, K. L., & Marques, M. I. Vocal behavior of the Undulated Tinamou (Crypturellus undulatus) over an annual cycle in the Brazilian Pantanal: New ecological information. Biotropica, 52(1), 165-171.
Identificador de la referencia http://reporte.humboldt.org.co/biodiversidad/2018/cap1/103/
Referencia Rodríguez-Buriticá, S., Savage, D., Caycedo, P., Acevedo-Charry, O., Isaza, C., Daza, J. M., Almeira, J., Ulloa, J. S., Orozco-Alzate, M., Villamizar, N., Ruiz, J. F., Lopera, A., Oliver, B., Laverde, O. Pijanowski, B., & Red Ecoacústica Colombiana. (2019). Paisajes sonoros de Colombia: La otra dimensión de la biodiversidad. En Reporte de Estado y Tendencia de la biodiversidad continental de Colombia 2018. Ficha 103. Bogotá D. C.: Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. Disponible en http://reporte.humboldt.org.co/biodiversidad/2018/cap1/103/
Datos de la Colección
Nombre de la colecciónColección de Sonidos Ambientales del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Identificador de la colecciónIAvH-CSA
Identificador de la colección parentalIAvH
Método de preservación de los especímenes Otro
UNIDAD CURATORIAL 1
Entre1
y40,704
Tipo de Unidadgrabaciones WAV y FLAC
Metadatos Adicionales
Nivel de jerarquíadataset
PropósitoCada lugar en el planeta tiene una huella acústica particular (Krause, 1987). Sin embargo, muchos lugares en el mundo aún no cuentan con información acústica registrada que permita caracterizar su huella. Similar a otros componentes de la biodiversidad, la colecta de sonidos puede abordarse desde una perspectiva activa y direccional (Parker, 1991), o puede ser integrado en muestreos pasivos con sensores acústicos automatizados que no incluyen interferencia por el observador (Aide et al., 2013; Rodríguez-Buriticá et al., 2019). El muestreo pasivo con sensores acústicos permite obtener datos de señales acústicas de manera efectiva, lo cual es una gran oportunidad para estudiar la biodiversidad tropical (Deichmann et al., 2018; Rodríguez-Buriticá et al., 2019). Un posible enfoque de esta herramienta es medir la huella acústica a partir del análisis de paisajes sonoros, los cuales pueden variar a través de gradientes de elevación (Campos-Cerqueira & Aide, 2017), en respuesta al disturbio (Deichmann et al., 2017) o por tipos de cobertura (Furumo & Aide, 2019). Adicionalmente, los datos obtenidos por muestreo pasivo con sensores acústicos permiten abordar preguntas direccionadas a la actividad acústica de especies en particular (Campos-Cerqueira & Aide, 2016). Entre 2018 y 2019, algunos proyectos del Instituto Humboldt incluyeron eventos de muestreo acústico pasivo para complementar muestreos de biodiversidad. Para esto, algunas veces fueron invitados investigadores de la Colección de Sonidos Ambientales IAvH-CSA, o fue solicitado apoyo a esta colección para poder tener muestras de este tipo dentro de los proyectos particulares. El objetivo de los muestreos fue compilar muestras acústicas de mínimo un día en diferentes lugares de Colombia que incluyen los Andes (Boyacá, Cundinamarca, Meta y Santander), la Amazonia (Caquetá) y el Caribe (Sucre y Bolívar), que contribuyeran al futuro crecimiento de la colección y al enriquecimiento del conocimiento ecoacústico del país.