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Colección de Peces de Agua Dulce del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-P)

Latest version published on 26 October 2021
I2D-BIO_2013_IPT015. La Colección de Peces de Agua Dulce del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-P) fue fundada en 1971 en Bogotá y luego trasladada a su ubicación actual en Villa de Levya en 1995. La colección de peces es uno de los repositorios ictiológicos más grandes de Colombia con más de 22983 lotes catalogados y sistematizados en el software Specify. Esta colección contiene muestras de alrededor de 3100 localidades de los principales sistemas hidrográficos (Amazonas, Orinoco, Magdalena-Cauca y las vertientes del Caribe y el Pacífico), además de todos los departamentos colombianos. En términos taxonómicos, se encuentran representadas alrededor de 1150 especies, aproximadamente el 74% del número total de especies dulceacuícolas nativas regis... More

Description

I2D-BIO_2013_IPT015. La Colección de Peces de Agua Dulce del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-P) fue fundada en 1971 en Bogotá y luego trasladada a su ubicación actual en Villa de Levya en 1995. La colección de peces es uno de los repositorios ictiológicos más grandes de Colombia con más de 22983 lotes catalogados y sistematizados en el software Specify. Esta colección contiene muestras de alrededor de 3100 localidades de los principales sistemas hidrográficos (Amazonas, Orinoco, Magdalena-Cauca y las vertientes del Caribe y el Pacífico), además de todos los departamentos colombianos. En términos taxonómicos, se encuentran representadas alrededor de 1150 especies, aproximadamente el 74% del número total de especies dulceacuícolas nativas registradas para el país. El IAvH-P almacena también especies procedentes de otros países neotropicales (Brasil, Costa Rica, Ecuador, Guayana Francesa, Guyana, Panamá, Perú y Venezuela). Más de 80 especies nominales están representadas por ejemplares tipo, de las cuales 20 corresponden a holotipos y la información asociada se encuentra disponible en el catálogo de ejemplares tipo en línea, con imágenes en alta resolución. Los registros se encuentran disponibles a través de las plataformas SIB-Colombia, GBIF y CEIBA. En la actualidad, estamos desarrollando un aplicativo que permita obtener la información de los diferentes repositorios en línea, unificando los datos asociados a un espécimen (fotografía, radiografía, enlaces a las secuencias publicadas de ADN, así como los archivos de los artículos científicos, entre otros contenidos multimedia).

Rights

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Libre a nivel interno y externo (Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0)

Data Records

The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 22,983 records.

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How to cite

Researchers should cite this work as follows:

Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. (2019). Colección de Peces del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-P). 22983 registros. http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=peces_coleccion_instituto_humboldt

Keywords

Peces; Actinopterygii; Chondrichthyes; Dipnotetrapodomorpha; Holotipo; Paratipo; registro biológico; espécimen

External data

The resource data is also available in other formats

Colección de Peces de Agua Dulce del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-P) http://ipt.biodiversidad.co/iavh/resource.do?r=peces_coleccion_instituto_humboldt UTF-8 txt
Illustrated and online catalog of type specimens of freshwater fishes in the Colección de Peces Dulceacuícolas of Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-P), Colombia http://dx.doi.org/10.11646/zootaxa.4171.3.1 UTF-8 pdf
Ejemplares Tipo de la colección de Peces de Agua Dulce https://sites.google.com/humboldt.org.co/tipospeces/inicio UTF-8 web

Contacts

Who created the resource:

Carlos-Luis Donascimiento-Montoya
Curador colección de peces
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Carrera 8 # 15-08
Villa de Leyva
Boyacá
CO
3202767
http://www.humboldt.org.co

Who can answer questions about the resource:

Carolina Gómez-Posada
Coordinadora
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Carrera 8 # 15-08
Villa de Leyva
Boyacá
CO
3202767
http://www.humboldt.org.co

Who filled in the metadata:

Kevin-Giancarlo Borja-Acosta
Curador de datos colecciones biológicas
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Carrera 8 # 15-08
Villa de Leyva
Boyacá
CO
3202767
http://www.humboldt.org.co

Who else was associated with the resource:

Processor
Carlos Montaña
Asistente de Investigación 1
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Claustro San Agustín
Villa de Leyva
Boyacá
CO
3202767
http://www.humborldt.org.co
Author
Juan-Gabriel Albornoz
Investigador
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Carrera 8 # 15-08
Villa de Leyva
Boyacá
CO
3202767
Author
Alejandro Mendez-Lopez
Investigador
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Carrera 8 # 15-08
Villa de Leyva
Boyacá
CO
3202767
Custodian Steward
Infraestructura Institucional de Datos
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt
Calle 28A No. 15-09
578 Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
3202767
http://www.humboldt.org.co
Processor
Erika Marcela Muñoz Martínez
Pasante de sistematización colecciones biológicas
Instituto de investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Carrera 8 # 15-08
57 Villa de Leyva
Boyacá
CO

Geographic Coverage

Los registros de la colección son principalmente de Colombia, La clasificación departamental y municipal sigue la clasificación del DANE. Adicionalmente cuenta con registros de los siguientes países: Costa Rica, Ecuador, Guayana Francesa, Guyana, Panamá, Perú y Venezuela. Cuenta con registros de especímenes de los 32 departamentos de Colombia.

Bounding Coordinates South West [-17.68, -83.858], North East [13.57, -34.8]

Taxonomic Coverage

Los ejemplares están determinados a Familia, Género o Especie, el estatus o validez de los nombres científicos sigue la versión en línea más reciente del Catalog of Fishes de California Academy of Sciences: http://researcharchive.calacademy.org/research/ichthyology/catalog/fishcatmain.asp (Eschmeyer et al.), ademas para la clasificación de taxones de rangos taxonómicos superiores (Clase a Subrorden) se siguió a Betancur-R. et al. (2017). Para los siguientes grupos se siguieron los trabajos señalados: Orden Gymnotiformes: Tagliacollo et al. (2016), orden Characiformes: Mirande (2009, 2010) y Oliveira et al. (2011), orden Siluriformes: Sullivan et al. (2006), superfamilia Doradoidea: Birindelli (2014), superfamilia Pimelodoidea: Sullivan et al. (2013), familia Cichlidae: López-Fernández et al. (2010), subfamilia Stevardiinae: Thomaz et al. (2015), subfamilia Hypostominae: Lujan et al. (2015), subfamilias Hypoptopomatinae y Otothyrinae: Roxo et al. (2014), subfamilia Loricariinae: Covain et al. (2016), los grupos restantes: Nelson et al. (2016).

Order  Characiformes,  Siluriformes,  Cyprinodontiformes,  Mugiliformes,  Gobiiformes,  Gymnotiformes,  Cichliformes,  Synbranchiformes,  Incertae Sedis,  Clupeiformes,  Ceratodontiformes,  Uranoscopiformes,  Carangiformes,  Cypriniformes,  Myliobatiformes,  Batrachoidiformes,  Elopiformes,  Ephippiformes,  Tetraodontiformes,  Pleuronectiformes,  Beloniformes,  Anabantiformes,  Osteoglossiformes,  Gobiesociformes,  Spariformes,  Gerreiformes,  Salmoniformes,  Centrarchiformes,  Syngnathiformes,  Anguilliformes

Temporal Coverage

Start Date / End Date 1899-12-31 / 2020-11-30

Project Data

No Description available

Title Colecciones Biológicas del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Funding Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Study Area Description La colección cuenta con representación en los 32 departamentos del territorio Nacional, a nivel de regiones naturales se encuentra mejor representada en las regiones Andina y Orinoquia.
Design Description Ejemplares depositados en las colecciones biológicas del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt.

The personnel involved in the project:

Metadata Provider
Kevin-Giancarlo Borja-Acosta

Sampling Methods

Los ejemplares de la colección han sido capturados con métodos como: atarraya, electropesca, captura manual entre otros, sin embargo existe una incertidumbre grande pues se desconoce en gran parte dada la a antigüedad y procedencia de la colección.

Study Extent Las zonas hídricas de agua dulce del territorio nacional.
Quality Control Los ejemplares deben haber sido fijados en formol al 10% y preservados en etanol al 70%. Los ejemplares deben encontrarse fijados en una posición natural (i.e. no retorcidos) y enteros (i.e. sin disecciones y órganos internos no removidos). La información mínima asociada a los ejemplares incluye (para el caso de ejemplares provenientes de Colombia): datos completos de localidad de captura (departamento, municipio, nombre o descripción de la localidad específica, coordenadas geográficas), fecha de captura, nombres completos de los colectores e información detallada del permiso de colecta que avala la captura de los ejemplares. Información adicional (ejemplo hora de captura, arte pesca o método de captura, descripción del hábitat, medición de parámetros fisicoquímicos del cuerpo de agua donde se obtuvieron los ejemplares, mediciones de los ejemplares) es también documentada.

Method step description:

  1. Transcripción de catálogos físicos en Hoja de Excel (Archivo de Migración), validación de información geográfica de registros por parte de I2D, verificación de número de ejemplares por registro e identificación taxonómica hasta el nivel más detallado posible, ingreso de nuevos Números de Catálogo directamente en el Archivo de Migración, migración de registros desde Archivo de Migración a Specify y generación de archivo Darwin Core desde Specify.

Collection Data

Collection Name Colección de Peces de Agua Dulce del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Collection Identifier IAvH-P
Parent Collection Identifier IAvH
Specimen preservation methods Alcohol

Bibliographic Citations

  1. Betancur-R. R, Wiley EO, Arratia G, Acero A, Bailly N, Miya M, Lecointre G, Ortí G (2017) Phylogenetic classification of bony fishes. BMC Evolutionary Biology 2017: 162. https://doi.org/10.1186/s12862-017-0958-3
  2. Birindelli JLO (2014) Phylogenetic relationships of the South American Doradoidea (Ostariophysi: Siluriformes) Neotropical Ichthyology 12: 451–564. https://doi.org/10.1590/1982-0224-20120027.
  3. Covain R, Fisch-Muller S, Oliveira C, Mol JH, Montoya-Burgos JI, Dray S (2016) Molecular phylogeny of the highly diversified catfish subfamily Loricariinae (Siluriformes, Loricariidae) reveals incongruences with morphological classification. Molecular Phylogenetics and Evolution 94: 492–517. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2015.10.018
  4. Eschmeyer WN, Fricke R, van der Laan R (eds). CATALOG OF FISHES: GENERA, SPECIES, REFERENCES. http://researcharchive.calacademy.org/research/ichthyology/catalog/fishcatmain.asp
  5. López-Fernández H, Winemiller KO, Honeycutt RL (2010) Multilocus phylogeny and rapid radiations in Neotropical cichlid fishes (Perciformes: Cichlidae: Cichlinae). Molecular Phylogenetics and Evolution 55: 1070–1086. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2010.02.020
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  7. Mirande JM (2009) Weighted parsimony phylogeny of the family Characidae (Teleostei: Characiformes). Cladistics 25: 1–40. https://doi.org/10.1111/j.1096-0031.2009.00262.x.
  8. Mirande JM (2010) Phylogeny of the family Characidae (Teleostei: Characiformes) from characters to taxonomy. Neotropical Ichthyology 8: 385–568. https://doi.org/10.1590/S1679-62252010000300001.
  9. Nelson JS, Grande T, Wilson MVH (2016) Fishes of the world. Fifth edition. John Wiley & Sons, Hoboken, 707 pp. https://doi.org/10.1002/9781119174844.
  10. Oliveira C, Avelino GS, Abe KT, Mariguela TC, Benine RC, Ortí G, Vari RP Corrêa e Castro RM (2011) Phylogenetic relationships within the speciose family Characidae (Teleostei: Ostariophysi: Characiformes) based on multilocus analysis and extensive ingroup sampling. BMC Evolutionary Biology 11: 275. https://doi.org/10.1186/1471-2148-11-275.
  11. Roxo FF, Albert JS, Silva GSC, Zawadzki CH, Foresti F, Oliveira C (2014) Molecular phylogeny and biogeographic history of the armored Neotropical catfish subfamilies Hypoptopomatinae, Neoplecostominae and Otothyrinae (Siluriformes: Loricariidae). PLoS ONE 9: e105564. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0105564.
  12. Sullivan JP, Lundberg JG, Hardman M (2006) A phylogenetic analysis of the major groups of catfishes (Teleostei: Siluriformes) using rag1 and rag2 nuclear gene sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution 41: 636–662. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2006.05.044.
  13. Sullivan JP, Muriel-Cunha, J Lundberg JG (2013) Phylogenetic relationships and molecular dating of the major groups of catfishes of the Neotropical superfamily Pimelodoidea (Teleostei, Siluriformes) Proceedings of the Academy of Natural Sciences of Philadelphia 162: 89–110. https://doi.org/10.1635/053.162.0106.
  14. Tagliacollo VA, Bernt MJ, Craig JM, Oliveira C, Albert JS (2016) Model-based total evidence phylogeny of Neotropical electric knifefishes (Teleostei, Gymnotiformes) Molecular Phylogenetics and Evolution 95: 20–33. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2015.11.007.
  15. Thomaz AT, Arcila D, Ortí G, Malabarba LR (2015) Molecular phylogeny of the subfamily Stevardiinae Gill, 1858 (Characiformes: Characidae): classification and the evolution of reproductive traits. BMC Evolutionary Biology 15: 146. https://doi.org/10.1186/s12862-015-0403-4.

Additional Metadata

Purpose La Colección de Peces de Agua Dulce del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-P) fue fundada en 1971 en Bogotá y luego trasladada a su ubicación actual en Villa de Levya en 1995. La colección de peces es uno de los repositorios ictiológicos más grandes de Colombia con más de 22983 lotes catalogados y sistematizados en el software Specify. Esta colección contiene muestras de alrededor de 3100 localidades de los principales sistemas hidrográficos (Amazonas, Orinoco, Magdalena-Cauca y las vertientes del Caribe y el Pacífico), además de todos los departamentos colombianos. En términos taxonómicos, se encuentran representadas alrededor de 1150 especies, aproximadamente el 74% del número total de especies dulceacuícolas nativas registradas para el país. El IAvH-P almacena también especies procedentes de otros países neotropicales (Brasil, Costa Rica, Ecuador, Guayana Francesa, Guyana, Panamá, Perú y Venezuela). Más de 80 especies nominales están representadas por ejemplares tipo, de las cuales 20 corresponden a holotipos y la información asociada se encuentra disponible en el catálogo de ejemplares tipo en línea, con imágenes en alta resolución. Los registros se encuentran disponibles a través de las plataformas SIB-Colombia, GBIF y CEIBA. En la actualidad, estamos desarrollando un aplicativo que permita obtener la información de los diferentes repositorios en línea, unificando los datos asociados a un espécimen (fotografía, radiografía, enlaces a las secuencias publicadas de ADN, así como los archivos de los artículos científicos, entre otros contenidos multimedia).
Alternative Identifiers http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=peces_coleccion_instituto_humboldt