Atlas de la Biodiversidad de Colombia Aves endémicas

Maria Helena Olaya Rodriguez1, Maria Helena Olaya2, Infraestructura Institucional de Datos3, Alejandra Gonzalez-Moncada4, Andrea Lopera-Salazar5, Andrés Chinome6, Andres Cuervo7, Ángela Caguazango8, Aura Fiorela Delgado-Chaves9, Camilo Sánchez-Sarria10, Camilo Sierra-F4, Carolina Diaz-Jaramillo11, César Antonio Ríos-Muñoz12, Daniel Badillo-Mojica13, Danny Zapata-Henao14, David Alexander Prieto-Torres12, David Ocampo15, David Ricardo Rodríguez-Villamil16, Dennys Plazas-Cardona9, Diego Carantón-Ayala17, Enrique Arbeláez-Cortés18, Esteban Botero-Delgadillo8, Fernando Cediel19, Gerson Peñuela-Díaz20, Hugo Vides21, Jefry Stifen Betancur-Ortiz22, Jeyson Sanabria-Mejía23, Jhon Jairo Calderon-Leyton24, Juan Luis Parra6, Juan Miguel Ruiz-Ovalle25, Julian Llano Mejia26, Liliana Patricia Paz-Betancourt27, Lina María Caro28, Luis Alfonso Ortega-Fernández27, Marcia Carolina Muñoz4, Maria  Angela Echeverry-Galvis29, Natalia Pérez-Amaya30, Nicholas Bayly8, Orlando Acevedo-Charry31, Oscar H Marín-Gómez32, Ron A. Fernández33, Ruben Dario Palacio34, Sandra Escudero Paez35, Sebastian Pérez-Peña36, Sergio Andrés Collazos-González37, Sergio Chaparro-Herrera38, Sergio Losada-Prado39, Sergio Reyes40, Yanira Cifuentes-Sarmiento41, Carlos J. Muñoz-Rodríguez36, Elkin A. Noguera-Urbano36, Lina Sánchez42, Juan Carlos Rey36, Laura Sofia Garcia Castro42, César Gutiérrez42, Camilo Alberto Zapata42, Érika Suárez Valencia42

1 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Av Circunvalar #1620, Bogotá, D.C., Colombia; 2 Instituto de Investigaciones Biológicas Alexander von Humboldt, Calle 72 #  12 - 65 Piso 7, Bogotá, D.C., Colombia; 3 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Avenida Paseo Bolívar # 16-20, 110321, Bogotá, D.C.; 4 Universidad de La Salle, , Colombia; 5 Grupo de Ecología y Evolución de Vertebrados-Universidad de Antioquia, , Colombia; 6 Universidad de Antioquia, , Colombia; 7 Instituto de Ciencias Naturales, Universidad Nacional de Colombia, , Colombia; 8 SELVA-Investigación para la Conservación en el Neotropico, , Colombia; 9 Universidad Nacional de Colombia, , Colombia; 10 Instituto de Ecología, A. C., , Colombia; 11 Instituto de Estudios Ambientales - IDEA (Bogotá), Universidad Nacional de Colombia, National University of Colombia, , Colombia; 12 Universidad Nacional Autónoma de México, , Mexico; 13 Grupo de Estudios en Paisajes Socio-Ecológicos, , Colombia; 14 Sociedad Antioqueña de Ornitología, , Colombia; 15 Princeton University, , United States; 16 Semillero de Investigación Grupo de Ornitología de la Universidad Pedagógica Nacional, , Colombia; 17 Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas SINCHI, , Colombia; 18 Escuela de Biología, Facultad de Ciencias, Universidad Industrial de Santander, , Colombia; 19 Sociedad Ornitológica del Nororiente Andino, , Colombia; 20 Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia, , Colombia; 21 Universidad de Cartagena, , Colombia; 22 Universidad de Antioquia- Sociedad Antioqueña de Ornitología, , Colombia; 23 SELVA-Investigación para la Conservación en el Neotropico/Arbóreo, , Colombia; 24 UDENAR/ ASOCIACION GAICA, , Colombia; 25 Fundación Ecotrópico - Colombia, Instituto Nacional de Pesquisas Amazónicas (INPA), , Colombia; 26 Terrasos, , Colombia; 27 Fundación Ecohabitats, , Colombia; 28 Wildlife Conservation Society, , Colombia; 29 Pontificia Uiversidad Javeriana, , Colombia; 30 Universidad Nacional de Colombia - ACO, njpereza@unal.edu.co, , Colombia; 31 Asociación Colombiana de Ornitología, , Colombia; 32 Universidad del Quindio, , Colombia; 33 Universidad Veracruzana | GAICA, , Colombia; 34 Fundación Ecotonos, , Colombia; 35 Autonoma, , Colombia; 36 Instituto Humboldt, , Colombia; 37 Pontificia Universidad Javeriana, , Colombia; 38 Laboratorio de Ecología Evolutiva y Urbana, Universidad del Norte, , Colombia; 39 Universidad del Tolima, , Colombia; 40 Kaestneri-Asociación Ornitológica de Cundinamarca, , Colombia; 41 Asociación Calidris, , Colombia; 42 Instituto  Humboldt, , Colombia

Corresponding author(s): Maria Helena Olaya Rodriguez (molaya@humboldt.org.co)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Chaparro-Herrera, S., Acevedo-Charry, O., Ocampo, D., Echeverry-Galvis, M. et al. (2024). Atlas de la biodiversidad de Colombia. Aves Endémicas. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. Bogotá D. C., Colombia. 100 pp.

Abstract

I2D-BIO_2024_006. En el país se han registrado 1968 especies de aves hasta el momento (Echeverry-Galvis et al., 2022), siendo el de mayor riqueza en el mundo. Para las personas interesadas en las aves y tomadores de decisiones, este privilegio también implica grandes responsabilidades respecto de la conservación de sus hábitats a escala nacional, regional y local. Documentar la diversidad de aves, sus historias de vida e interacciones dentro de cada ecosistema es una labor titánica que sigue siendo una prioridad en Colombia. Para especies cuya distribución está restringida al territorio nacional, la tarea es aún más esencial.
Es por esto que quisimos proponer un atlas de las aves endémicas de Colombia. Para este atlas se obtuvieron mapas de distribución para 83 especies de aves endémicas de Colombia, incluyendo la distribución histórica de Podiceps andinus. De estas, 79 de las distribuciones potenciales generadas fueron modeladas con la revisión y edición de expertos, mientras que para 3 especies se obtuvieron mapas de expertos. Esto dio lugar a mapas de distribución, potencial y remanente para 82 especies. Para la especie restante se presenta un mapa de distribución potencial proveniente de los resultados de otros investigadores (mapas publicados por expertos). Es importante aclarar que Grallaria alvarezi y Grallaria spatiator, especies endémicas de Colombia, no hacen parte de la presente edición del atlas, dado que ambas especies fueron descritas recientemente y, por tanto, tenían una baja disponibilidad de información en el momento que se curaron los registros y se corrieron los modelos de distribución. Tampoco se alcanzó a incluir a Chloropipo flavicapilla, quien recientemente fue reevaluada como especie endémica para Colombia (Palacio, 2023).
En este conjunto de datos se incluyeron los registros relacionados a los modelos de las 79 especies que fueron desarrollados por expertos asociados al grupo Aves de Colombia en BioModelos e investigadores del Instituto Humboldt entre los años 2020 y 2023.

Keywords: BioModelos, conservación, departamentos, aves endémicas, lista de chequeo, mapas, modelos de distribución, aves neotropicales., Occurrence, Observation

General description

Purpose: Aportar al conocimiento de diversidad y distribución de 79 especies de aves endémicas de Colombia.

Project details

Project title: Atlas de la biodiversidad de Colombia aves endémicas
Personnel: Maria Helena Olaya Rodriguez
Study area descriptions/descriptor: El área de estudio de este proyecto abarca todo el territorio Colombiano incluyendo las islas de San Andrés y Providencia.
Design description: Los datos y registros se tomaron de la bases de datos abiertos de información sobre biodiversidad de las especies de aves endémicas de Colombia para el desarrollo de MDE a través de la plataforma BioModelos para la construcción del Atlas de la biodiversidad de Colombia aves endémicas.

Data published through GBIF: https://i2d.humboldt.org.co/resource?r=atlas_aves_endemicas

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Se presentan los registros de 79 especies de aves endémicas, de las cuales se genero el modelo de distribución potencial. La esmeralda del Chiribiquete (Chlorostilbon olivaresi) debido a la escasez de información disponible no fue incluida en el atlas. En el caso de Podiceps andinus es una especie considerada extinta por lo cual en el atlas se presento su distribución histórica. Es importante aclarar que Grallaria alvarezi y Grallaria spatiator, especies endémicas de Colombia, no hacen parte de la presente edición del atlas, dado que ambas especies fueron descritas recientemente y, por tanto, tenían una baja disponibilidad de información en el momento que se curaron los registros y se corrieron los modelos de distribución. Tampoco se alcanzó a incluir a Chloropipo flavicapilla, quien recientemente fue reevaluada como especie endémica para Colombia
(Palacio, 2023).
Taxonomic ranks
Species: Anisognathus melanogenys, Anthocephala berlepschi, Anthocephala floriceps, Arremon basilicus, Atlapetes blancae, Atlapetes flaviceps, Atlapetes fuscoolivaceus, Atlapetes melanocephalus, Bangsia aureocincta, Bangsia melanochlamys, Bolborhynchus ferrugineifrons, Bucco noanamae, Campylopterus phainopeplus, Capito hypoleucus, Cercomacroides parkeri, Chaetocercus astreans, Chlorochrysa nitidissima, Cistothorus apolinari, Clibanornis rufipectus, Coeligena orina, Coeligena phalerata, Coeligena prunellei, Cranioleuca hellmayri, Crax alberti, Dacnis hartlaubi, Diglossa gloriosissima, Drymophila caudata, Drymophila hellmayri, Eriocnemis mirabilis, Euphonia concinna, Grallaria bangsi, Grallaria kaestneri, Grallaria milleri, Grallaria urraoensis, Habia cristata, Habia gutturalis, Hapalopsittaca fuertesi, Henicorhina anachoreta, Henicorhina negreti, Hypopyrrhus pyrohypogaster, Lepidopyga lilliae, Leptotila conoveri, Lipaugus weberi, Macroagelaius subalaris, Megascops gilesi, Melanerpes pulcher, Myiarchus apicalis, Myioborus flavivertex, Myiotheretes pernix, Myiothlypis basilica, Myiothlypis conspicillata, Odontophorus hyperythrus, Odontophorus strophium, Ortalis columbiana, Ortalis garrula, Oxypogon cyanolaemus, Oxypogon guerinii, Oxypogon stuebelii, Penelope perspicax, Phylloscartes lanyoni, Picumnus granadensis, Psarocolius cassini, Pyrrhura calliptera, Pyrrhura viridicata, Rallus semiplumbeus, Ramphomicron dorsale, Saucerottia castaneiventris, Saucerottia cyanifrons, Scytalopus alvarezlopezi, Scytalopus canus, Scytalopus latebricola, Scytalopus rodriguezi, Scytalopus sanctaemartae, Scytalopus stilesi, Synallaxis fuscorufa, Synallaxis subpudica, Thryophilus nicefori, Thryophilus sernai, Troglodytes monticola, Eriocnemis isabellae
Common names: TÁNGARA DE SANTA MARTA, COLIBRÍ FLORIDO DE TOLIMA, COLIBRÍ CABECICASTAÑO, PINZÓN DE LA SIERRA NEVADA, GORRIÓN MONTÉS PAISA, ATLAPETES DE ANTEOJOS, ATLAPETES OLIVÁCEO, ATLAPETES DE SANTA MARTA, BANGSIA DE TATAMÁ, BANGSIA NEGRA Y ORO, PERIQUITO DE LOS NEVADOS, BOBO DE NOANAMÁ, ALA DE SABLE DE SANTA MARTA, TORITO CAPIBLANCO, HORMIGUERO DE PARKER, ZUMBADOR DE SANTA MARTA, TÁNGARA MULTICOLOR, CUCARACHERO DE APOLINAR, HOJARASQUERO DE SANTA MARTA, INCA DE FRONTINO, INCA COLIBLANCO, INCA NEGRO, RASTROJERO CORONADO, PAVÓN COLOMBIANO, DACNIS TURQUESA, DIGLOSA PECHIRRUFA, HORMIGUERO COLILARGO, HORMIGUERO DE SANTA MARTA, PARAMERO DE MUNCHIQUE, EUFONIA FRENTINEGRA, TOROROI DE SANTA MARTA, TOROROI DE CUNDINAMARCA, TOROROI DE MILLER, TOROROI DE URRAO, HABIA COPETONA, HABIA AHUMADA, COTORRA ALIAZUL, CUCARACHERO ANACORETA, CUCARACHERO DE MUNCHIQUE, CHANGO COLOMBIANO, COLIBRÍ CIENAGUERO, CAMINERA TOLIMENSE, ARRIERITO ANTIOQUEÑO, CHANGO DE MONTAÑA, CURRUCUTÚ DE SANTA MARTA, CARPINTERO BELLO, ATRAPAMOSCAS APICAL, ABANICO COLOMBIAO, ATRAPAMOSCAS DE SANTA MARTA, ARAÑERO DE SANTA MARTA, ARAÑERO EMBRIDADO, CORCOVADO CASTAÑO, CORCOVADO GORJIBLANCO, GUACHARACA COLOMBIANA, GUACHARACA CARIBEÑA, COLIBRÍ CHIVITO DE SANTA MARTA, BARBUDITO PARAMUNO, COLIBRÍ CHIVITO DEL RUÍZ, PAVA CAUCANA, TIRANUELO ANTIOQUEÑO, CARPINTERITO PUNTEADO, OROPENDOLA DEL BAUDÓ, PERIQUITO ALIAMARILLO, PERIQUITO SERRANO, TINGUA BOGOTANA, PICO DE TUNA NEGRO, QUINCHA DE SOATA, AMAZILIA CIÁNEO, TAPACULO DE TATAMÁ, TAPACULO DE PARAMILLO, TAPACULO RATÓN, TAPACULO DE RODRÍGUEZ, TAPACULO VENTRIRRUFO, TAPACULO DE STILES, RASTROJERO SERRANO, RASTROJERO RABILARGO, CUCARACHERO DE NICÉFORO, CUCARACHERO PAISA, CUCARACHERO DE SANTA MARTA, ZAMARRITO DEL PINCHE

Spatial coverage

General spatial coverage: Cobertura geográfica de todo el territorio colombiano, incluyendo las islas de San Andrés y Providencia.
Coordinates: 4°13'48''S and 13°24'36''N Latitude; 80°0'0''W and 66°42'36''W Longitude 

Temporal coverage: April 12, 1971 - November 20, 2020

Methods

Method step description: Remitirse a la siguiente URL para obtener la metodología implementada, dentro del "Atlas de la biodiversidad de Colombia aves endémicas", página 94: https://biomodelos.humboldt.org.co/atlas/AvesEndemicas.pdf
Study extent description: Los registros abarcan el área que compone el territorio nacional de Colombia, incluyendo las islas de San Andrés y Providencia.
Sampling description: Los registros de presencia de las aves endémicas fueron obtenidos de repositorios en línea, como el Sistema Global de Información sobre Biodiversidad (Global Biodiversity Information Facility - GBIF) y su nodo: el Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia (SiB Colombia), literatura científica especializada, observaciones de campo realizadas por los autores y revisión de colecciones biológicas del país. En total se compilaron más de 100.000 registros de 79 especies, en donde más del 80% provienen del portal eBird (Sullivan et al., 2009; Auer et al., 2020; https://ebird.org/colombia/home).
Quality control description: Los datos fueron curados y revisados de acuerdo con los arreglos taxonómicos del grupo de aves endémicas. Para ello se eliminaron registros erróneos usando las herramientas de curación de datos de BioModelos (Velásquez-Tibatá et al., 2019) y se eliminaron los datos duplicados con una distancia de 1 km2. El promedio de registros por especie fue de 126, con un rango entre 6 y 2.502 registros (Q1 = 24, mediana = 44, Q3 = 100). Asimismo, Los expertos del grupo Aves de Colombia de BioModelos revisaron los modelos finales (ensambles de los estadísticamente aceptables) de todas las especies y seleccionaron en consenso el umbral que mejor representó la distribución por especie de acuerdo con su conocimiento y experiencia. Igualmente, estos expertos editaron las áreas de subpredicción y sobrepredicción de los modelos (en caso de que las hubiera) y proveyeron instrucciones específicas para el refinamiento del modelo de distribución original.

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Atlas de la Biodiversidad de Colombia Aves endémicas
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: https://i2d.humboldt.org.co/archive.do?r=atlas_aves_endemicas
Publication date of data: 2025-07-28
Language: Spanish
Licences of use: Libre a nivel interno y externo (Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0)

External datasets

Dataset description
Object name: Atlas de la biodiversidad de Colombia aves endémicas
Character encoding: UTF-8
Format name: pdf
Distribution: https://biomodelos.humboldt.org.co/atlas/AvesEndemicas.pdf

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2024-05-23
Hierarchy level: Dataset

References
Echeverry-Galvis, M. A., Acevedo-Charry, O., Avendaño, J. E., Gómez, C., Stiles, F.G., Estela F. A., & Cuervo, A. M. (2022). Lista oficial de las aves de Colombia 2022: Adiciones, cambios taxonómicos y actualizaciones de estado. Ornitología Colombiana, 22, 25-51. https://doi.org/10.59517/oc.e548
Palacio, R. D. (2023). A reappraisal of the distribution of the Yellow-headed Manakin (Chloropipo flavicapilla) in Colombia and Ecuador. Ornitología Colombiana, 23, 31–37. https://doi.org/10.59517/oc.e554
Sullivan, B. L., Wood, C. L., Iliff, M. J., Bonney, R. E., Fink, D., & Kelling, S. 2009. eBird: a citizen-based bird observation network in the biological sciences. Biological Conservation, 142, 2282-2292.
Auer, T., Barker, S., Barry, J., Charnoky, M., Curtis, J., Davies., … & Wood C (2020). EOD – eBird Observation Dataset. Cornell Lab of Ornithology. Occurrence dataset. https://doi.org/10.15468/aomfnb accessed via GBIF.org on 2020-01-26 https://doi.org/10.15468/aomfnb
Velásquez-Tibatá, J., Olaya-Rodríguez, M. H., López-Lozano, D., Gutiérrez, C., González, I., & Londoño-Murcia, M. C. (2019). BioModelos: a collaborative online system to map species distributions. PLoS ONE, 14(3), e0214522. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0214522