Caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio -  Proyecto FIBRAS

Paola Pulido Santacruz1, Paola Pulido-Santacruz2, Ecopetrol. S.A.3, Nicolás Echeverry Montaña4, Infraestructura Institucional de Datos5

1 Instituto de Investigación de Rercursos Biológicos Alexander von Humboldt, Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá, D.C., Colombia; 2 Instituto de Investigación de Rercursos Biológicos Alexander von Humboldt, Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá, D.C., Colombia; 3 Ecopetrol. S.A., Carrera 7 # 32–42. Edificio San Martín Piso 32, Bogotá, D.C., Colombia; 4 Universidad de Los Andes, Carrera 1 #18a - 12, Bogotá, D.C., Colombia; 5 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Avenida Paseo Bolívar # 16-20, 110321, Bogotá, D.C., Colombia

Corresponding author(s): Paola Pulido Santacruz (pmontoya@humboldt.org.co)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Ecopetrol S.A., Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2022). Caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio -  Proyecto FIBRAS. http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=hongos_piedemontemagdalena_2022 http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=hongos_piedemontemagdalena_2022

Abstract

I2D-BIO_2022_118. Bajo el marco del convenio Fibras No. 19-155, entre el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt y ECOPETROL S.A.S y la Universidad de los ANDES, se llevó a cabo un muestreo de hongos. El muestreo se llevó a cabo entre marzo de 2021 y junio de 2021. El presente conjunto de datos contiene un total de 202 registros biológicos de hongos distribuidos en 3 filos, Ascomycota representado por 15 órdenes, Basidiomycota representado por 4 órdenes y Mucoromycota representado por 1 orden.

Keywords: aislamientos fúngicos, hongos cultivables, agua, suelo, sedimento, biodiversidad., Occurrence

General description

Purpose: Aunar esfuerzos técnicos, administrativos y financieros entre el Instituto Alexander von Humboldt y la Universidad de los Andes para caracterizar la diversidad funcional de hongos y realizar la caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables de las muestras ambientales, definidas por el supervisor del convenio por parte del Instituto, en el marco del Convenio No. 19-155 suscrito entre el Instituto Alexander von Humboldt y Ecopetrol S.A.

Project details

Project title: Proyecto FIBRAS
Personnel: Paola Pulido-Santacruz
Funding: Convenio FIBRAS, suscrito entre el Instituto Alexander von Humboldt (No. 19-155) y Ecopetrol S.A. (3025877)
Study area descriptions/descriptor: Este proyecto comprende áreas correspondientes a los departamentos del Huila, Casanare, Meta y la región del Magdalena Medio. En particular el componente 4b - Genómica, se enfocó en tres núcleos ubicados en los municipios de Neiva (Huila), Aguazul (Casanare), Tauramena (Casanare) , Barrancabermeja (Santander), El Carmen de Chucurí (Santander) y San Vicente de Chucurí.
Design description: El proyecto FIBRAS es un acuerdo de cooperación para la planificación y gestión de la biodiversidad y sus contribuciones al bienestar para cinco áreas del territorio colombiano, bajo criterios de conservación y desarrollo sostenible basados en información científica. Como parte de este convenio surge la conformación de seis Ecoreservas, identificadas como áreas de propiedad de Ecopetrol destinadas en parte o completamente a la conservación de la biodiversidad y oferta de servicios ecosistémicos, sin limitar su vocación productiva.

Data published through GBIF: http://i2d.humboldt.org.co/resource?r=hongos_piedemontemagdalena_2022

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Se obtuvo un total de 202 registros biológicos de hongos (Fungi) distribuidos en 3 filos, Ascomycota representado por 15 órdenes, Basidiomycota representado por 4 órdenes y Mucoromycota representado por 1 orden . La taxonomía propuesta sigue lineamientos básicos en micología y se basa en guías de identificación, claves dicotómicas, libros, artículos científicos y fue complementada con información genética.
Taxonomic ranks
Order: Amphisphaeriales, Botryosphaeriales, Chaetothyriales, Cladosporiales, Diaporthales, Eurotiales, Glomerellales, Helotiales, Hypocreales, Microascales, Pleosporales, Saccharomycetales, Sordariales, Venturiales, Xylariales, Cantharellales, Sporidiobolales, Trichosporonales, Ustilaginales, Mucorales

Spatial coverage

General spatial coverage: Piedemonte, Casanare y Magdalena medio, Santander
Coordinates: 5°3'10.8''N and 6°52'48''N Latitude; 73°45'32.4''W and 72°27'54''W Longitude 

Temporal coverage: March 14, 2021 - December 12, 2022

Natural collections description

Parent collection identifier: ANDES
Collection name: Museo de Historia Natural C.J. Marinkelle-Universidad de los Andes
Collection identifier: ANDES
Specimen preservation method: Other

Methods

Method step description: 
- . 	1. Toma de las muestras en campo: Manteniendo condiciones de esterilidad se tomaron muestras de agua suelo y sedimento en cada uno de los puntos de muestreo. Las muestra colectadas fueron transportadas en cadena de frío hasta su procesamiento en el laboratorio.
- . 	2. Procesamiento de las muestras ambientales:
2.1. Aislamiento de los hongos:
2.1.1. Agua: Filtración al vacío para concentrar los propágulos contenidos en las muestras de agua. Los filtros obtenidos fueron depositados boca arriba en cajas de Petri con agar papa dextrosa. 
2.1.2. Suelo y sedimento: Dilución y siembra en placa: Una muestra de suelo o sedimento (según corresponda), se suspendió en agua estéril y se procedió a diluir en una proporción de 1/10. Las diluciones 10e-1, 10e-3 y 10-5 se inocularon en cajas de agar papa dextrosa y agar rosa bengala por triplicado.
- . 	3. Purificación de los aislamientos en cultivos axénicos: Siguiendo las recomendaciones básicas de bioseguridad en laboratorios de microbiología, los hongos aislados fueron subcultivados en agar papa dextrosa hasta obtener cultivos axénicos, es decir, con un único hongo presente en el medio de cultivo.
- . 	4. Caracterización morfológica y genética de los aislamientos fúngicos: La caracterización morfológica se llevó a cabo a través de la descripción de rasgos micro y macroscópicos de cada aislamiento. Mientras la caracterización genética se llevó a cabo a través de la extracción de ADN, amplificación de uno o dos marcadores moleculares y la secuenciación de estos fragmentos por el método Sanger.
Study extent description: Piedemonte, Casanare y Magdalena medio, Santander
Sampling description: En cada punto de muestreo se tomaron 3 réplicas en un transecto de 20 m y recogieron muestras de agua, suelo y sedimento.
Quality control description: Durante el procesamiento de las muestras se pusieron controles de contaminación ambiental dejando cajas de Petri con agar papa dextrosa abiertas con el fin de registrar el crecimiento de hongos que estaban presentes en el ambiente durante el tiempo en el que se procesaron las muestras.

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio -  Proyecto FIBRAS
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: http://i2d.humboldt.org.co/archive.do?r=hongos_piedemontemagdalena_2022
Publication date of data: 2023-01-17
Language: Spanish
Licences of use: Libre a nivel interno y externo (Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0)

External datasets

Dataset description
Object name: Caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio -  Proyecto FIBRAS
Character encoding: utf-8
Format name: txt
Distribution: https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=ecopetrol-fibras_hongos-piedemontemagdalena

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2022-07-13
Hierarchy level: Dataset