Rasgos funcionales morfométricos de anfibios de complejos de páramos y humedales de Colombia

Oscar Dario Hernández Cordoba1, Oscar Dario Hernández Cordoba2, Angela Cortés3, Infraestructura Institucional de Datos4

1 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt, Calle 28  # 15-09, Bogota, D.C., Colombia; 2 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt, Calle 28 # 15-09, Bogota, D.C., Colombia; 3 Instituto de Investigación en Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt, Calle 28 # 15-09, Bogota, D.C., Colombia; 4 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá, D.C., Colombia

Corresponding author(s): Oscar Dario Hernández Cordoba (oscarhernandezcordoba@gmail.com)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2014). Rasgos funcionales morfométricos de anfibios de complejos de páramos y humedales de Colombia. 4699 registros, aportados por: Cortés, A. (Contacto del recurso, Creador del recurso), Hernández, C. (Proveedor de metadatos). http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=humedalparamo_amphibia_2014 http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=humedalparamo_amphibia_2014

Abstract

I2D-BIO_2014_IN009. 

Se obtuvieron las bases de datos de anfibios de las colecciones de: Instituto de ciencias Naturales (ICN), Universidad del Valle (UniValle), Instituto tecnológico metropolitano – Medellín (ITM-CSJ), Universidad de Antioquia (MUA-AVP), Pontificia Universidad Javeriana (UPJ), Instituto de investigaciones Alexander von Humboldt (IAvH) y Universidad Industrial de Santander (UIS-MHN), donde se filtraron y seleccionaron las especies reportadas a una altura mayor o igual a 2400 msnm y las especies asociadas a cuerpos de agua. A todos los especímenes medidos se les tomó la siguiente información: Colector (es),  Código de colección, sexo, país, municipio, localidad, complejo de páramo (según localidad), altura (dato de etiqueta ó estimado según localidad), genero, especie, nombre actual de la especie (según Frost et al. , Agosto de 2014), Longitud rostro cloaca, ancho de cabeza y boca, longitud antebrazo, tibia-fíbula, fémur y pie, membranas pedales y peso (esté ultimo tomado del dato de etiqueta).Entre diciembre de 2013 y Agosto de 2014, se revisaron 7 colecciones Herpetológicas del país con el fin de tomar rasgos funcionales pertenecientes a anfibios relacionados con ecosistemas de Páramos y Humedales, información que permitirá hacer un mapa de diversidad funcional del país. En total se midieron 4699 individuos, agrupados en 336 especies.

Keywords: anfibios, anuros, ranas, rasgos funcionales, páramos, humedales, bosque alto andino, Colombia, Occurrence, Specimen

General description

Purpose: Generar una base de datos de rasgos morfométricos de anfibios presentes en complejos de páramos y/o asociadas a cuerpos de agua en el territorio colombiano.
Additional information: Asociado a este recurso, se incorporó dentro de la Infraestructura Institucional de Datos (I2D) un documento con el resumen ejecutivo, que contiene la descripción y metodología para la generación de la base de datos, así como un análisis estadístico de la información de los rasgos funcionales.

Project details

Project title: Fondo Adaptación_Insumos para la Delimitación de Ecosistemas Estratégicos: Páramos y Humedales
Personnel: Angela Cortés
Funding: Fondo de adaptación. Contrato: 13-13-014-286PS entre el instituto Humboldt y Oscar Hernández.
Study area descriptions/descriptor: Complejos de páramos del territorio nacional, de acuerdo a la limitación generada por el Instituto Alexander von Humboldt, y cuerpos de agua de interior del país, excluyendo cuerpos de agua salada y/o costeros con el fin de identificar las aves presentes dentro de dichos complejos para la toma de rasgos morfométricos.
Design description: Estudiar los ecosistemas estratégicos de páramos y humedales del territorio nacional, para construir marcos conceptuales, metodológicos e información científica para elaborar insumos técnicos y recomendaciones de delimitación desde la perspectiva de la diversidad morfológica y funcional de fauna y flora.

Data published through GBIF: http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=humedalparamo_amphibia_2014

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Se tomaron datos de 336 especies de anfibios agrupadas en 12 familias, todas fueron clasificadas hasta la categoría de especie validada por Frost 2014. (http://research.amnh.org/vz/herpetology/amphibia/). En total se obtuvieron 4699 registros, de los cuales 73 registros agrupados en 8 especies pertenecen a la familia Aromobatidae, 795 registros agrupados en 52 especies en la familia Bufonidae, 240 registros agrupados en 31 especies en la familia Centrolenidae, 1042 registros agrupados en 90 especies pertenecen a la familia Craugastoridae, 237 registros pertenecientes a 21 especies en la familia Dendrobatidae, 5 registros de una especie para la familia Eleutherodactylidae, 65 registros agrupados en 11 especies en la familia Hemiphractidae, 1412 registros agrupados en 75 especies para la familia Hylidae, 646 registros agrupados en 35 especies para la familia Leptodactylidae, 91 registros agrupados en 7 especies para Microhylidae, 6 registros agrupados en dos especies para Pipidae y 87 registros para tres especies de la familia Ranidae.
Taxonomic ranks
Family: Aromobatidae, Bufonidae, Centrolenidae, Craugastoridae, Dendrobatidae, Eleutherodactylidae, Hemiphractidae, Hylidae, Leptodactylidae, Microhylidae, Pipidae, Ranidae
Common names: Ranas dardo, Sapos, Ranas de cristal, Ranas duende, Ranas dardo, Ranas coqui, Ranas marsupial, Ranas Arboricolas, Ranas de pozo, Ranas topo, Sapos parteros, Ranas toro

Spatial coverage

General spatial coverage: La cobertura geográfica de este producto abarca todas las localidades relacionadas a ecosistemas de Humedales y Páramos en el País.
Coordinates: 4°22'48''S and 12°35'24''N Latitude; 79°11'24''W and 67°1'48''W Longitude 

Temporal coverage: November 12, 2013 - September 5, 2014

Natural collections description

Parent collection identifier: N/A
Collection name: Colección Herpetológica Instituto de investigaciones Alexander von Humboldt, Museo de Historial natural de la universidad del Valle,  Museo de Historia narual del Instituto teconológico metropolitano, Museo de Historia Natural de la Universidad de Antioquia, Museo de Historia Natural de la Universidad industrial de Santander, Museo de Historia Natural de la Universidad Javeriana, Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional
Collection identifier: IAVH-am, UV-C, ITM-CSJ, UdeA, UIS, PUJ, ICN-MHN
Specimen preservation method: Alcohol

Methods

Method step description: 
- . 	Se hizo un filtro de especies por localidades de interés (páramos y humedales) a partir de la base de datos de cada colección, se seleccionaron las especies a medir, de las cuales solo se tomaron adultos, utilizando un calibrador digital se tomaron los rasgos funcionales y se compiló en una base de datos la información geográfica y taxonómica de cada individuo que ofrecía la colección biológica visitada. Se corroboró o se actualizó su identificación taxonómica en los casos que fue necesario. También se corroboró la información geográfica.
- . 	Se realizó la estructuración del conjunto de datos utilizando el estándar Darwin Core (DwC) y algunas de sus extensiones. Se utilizó el elemento "originalNameUsage" para documentar los nombres científicos tal cual se encontraban en las etiquetas ya que en muchos casos presentaban errores de ortografía o se encontraban desactualizados. Por otro lado, fue necesario utilizar los elementos "verbatimLocality", "verbatimLatitude" y "verbatimLongitude" para los casos en los que el país y/o departamento y/o municipio no coincidían con las coordenadas; se utilizó el elemento "georeferenceRemarks" para aclarar el tipo de inconsistencia que presentaba el registro en cuanto a la georreferenciación.
Study extent description: El área de estudio comprende todo el territorio nacional, todas las localidades de humedales y páramos donde se hayan colectado individuos de anuros y que a la fecha estén ingresados en una de las colecciones visitadas
Sampling description: Se midieron 20 individuos adultos de cada especie (cuando fue posible) registrada en localidades de humedales o páramos. Las medidas de los rasgos funcionales para anuros fueron: Longitud rostro-cloaca, ancho cabeza, ancho boca, longitud antebrazo, longitud tibia, longitud fémur y longitud pie. Los individuos fueron medidos preferiblemente del lado derecho, también se clasificó la longitud de la membrana pedial en: ausente, basal, expandida o muy expandida y se determinó el sexo cuando fue posible (no se realizó disección).
Quality control description: Las medidas fueron tomadas con un calibrador digital Mitutoyo (+- 0.05), las identificaciones dudosas de algunas especies fueron revisadas con las descripciones originales o se excluyeron del muestreo, la actualización taxonómica fue siguiendo a Frost 2014 y la clasificación de las membranas pediales fueron adaptadas a partir de la clasificación estandarizada de Savage (2002).

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Rasgos funcionales morfométricos de anfibios de complejos de páramos y humedales de Colombia
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/archive.do?r=humedalparamo_amphibia_2014
Publication date of data: 2021-12-14
Language: Spanish
Licenses of use: Libre a nivel interno y externo (Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0)

External datasets

Dataset description
Object name: A morphological database for Colombian anuran species from conservation-priority ecosystems
Character encoding: utf-8
Format name: pdf
Distribution: https://www.researchgate.net/profile/Angela-Mendoza-Henao/publication/331810911_Metadata_of_database_for_Colombian_anuran_species_from_conservation-priority_ecosystems/data/5c8d149445851564fae0fa70/ecy2685-sup-0002-metadatas1.pdf

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2014-10-08
Hierarchy level: Dataset

References
Frost, Darrel R. 2014. Amphibian Species of the World: an Online Reference. Version 6.0 (Date of access). Electronic Database accessible at http://research.amnh.org/herpetology/amphibia/index.html. American Museum of Natural History, New York, USA. http://research.amnh.org/vz/herpetology/amphibia/