Reptiles de la Ecoreserva Refinería (Santander, Barrancabermeja) - Proyecto FIBRAS

Daniela Garcia Cobos1, Infraestructura Institucional de Datos2, Ecopetrol. S.A.3, Daniela Garcia Cobos2

1 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá, D.C., Colombia; 2 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá, D.C., Colombia; 3 Ecopetrol. S.A., Carrera 7 # 32–42. Edificio San Martín Piso 32, Bogotá, D.C., Colombia

Corresponding author(s): Daniela Garcia Cobos (dgarciac@humboldt.org.co)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Ecopetrol S.A., Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2022). Reptiles de la Ecoreserva Refinería (Santander, Barrancabermeja) - Proyecto FIBRAS. 43 registros. http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=reptiles_refineria-fibras_2022 http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=reptiles_refineria-fibras_2022

Abstract

I2D-BIO_2022_024. Bajo el convenio de cooperación No. 19-155 entre ECOPETROL y el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexader von Humboldt, se llevó a cabo el levantamiento de la Línea Base de Biodiversidad y Servicios Ecosistémicos para seis predios piloto de Ecoreservas en predios de ECOPETROL, ubicados en cuatro regiones del país. Este levantamiento incluyó el desarrollo de muestreos rápidos de biodiversidad para siete grupos biológicos y la recolección de sonidos en predios ubicados en los departamentos del Huila, Casanare, Meta y la región del Magdalena Medio.  

El presente conjunto de datos contiene 43 registros de reptiles de la Ecoreserva Refinería ubicada en Santander, Barrancabermeja.

Keywords: reptiles, Santander, Barrancabermeja, Refinería, Specimen, Occurrence

General description

Purpose: Este conjunto de datos hace parte de la Línea Base de Biodiversidad y Servicios Ecosistémicos generada para seis Ecoreservas, identificadas como áreas de propiedad de Ecopetrol destinadas en parte o completamente a la conservación de la biodiversidad y oferta de servicios ecosistémicos, sin limitar su vocación productiva.

Project details

Project title: Proyecto FIBRAS
Personnel: Sandra P. Galeano
Funding: Convenio de cooperación No. 19-155 entre ECOPETROL y el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexader von Humboldt
Study area descriptions/descriptor: Este proyecto se llevó a cabo en áreas correspondientes a los departamentos del Huila, Casanare, Meta y la región del Magdalena Medio. En particular el componente de la Línea Base de Biodiversidad y Servicios Ecosistémicos de Ecoreservas, se enfocó en seis predios ubicados en los municipios de Neiva (Huila), Aguazul (Casanare), Puerto Gaitán (Meta),  Acacías y Castilla la Nueva (Meta) , Barrancabermeja (Santander)  y Cantagallo (Bolívar)
Design description: El proyecto FIBRAS es un acuerdo de cooperación para la planificación y gestión de la biodiversidad y sus contribuciones al bienestar para cinco áreas del territorio colombiano, bajo criterios de conservación y desarrollo sostenible basados en información científica. Como parte de este convenio surge la conformación de seis Ecoreservas, identificadas como áreas de propiedad de Ecopetrol destinadas en parte o completamente a la conservación de la biodiversidad y oferta de servicios ecosistémicos, sin limitar su vocación productiva.

Data published through GBIF: http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=reptiles_refineria-fibras_2022

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: El presente conjunto de datos contiene 43 registros de reptiles incluyendo 18 especies pertenecientes a 12 familias y tres órdenes. El orden más diverso fue el de los lagartos y las serpientes (Squamata), con una representatividad de 15 especies. Las tres especies restantes, pertenecieron al orden de los cocodrilos (1) y las tortugas (2). La familia con una mayor representatividad fue la de las serpientes cazadoras, Colubridae, con seis especies, seguida por la familia de los lagartos Anolis (Dactyloidae), con dos especies. Las diez familias restantes tuvieron una única especie representativa.
Taxonomic ranks
Species: Caiman crocodilus, Gonatodes albogularis, Liotyphlops bondensis, Hemidactylus frenatus, Iguana iguana, Chironius spixii, Erythrolamprus melanotus, Lygophis lineatus, Micrurus dumerilii, Oxybelis aeneus, Helicops danieli
Common names: Babilla, Lagartija, Culebra ciega, Salamanqueja, Iguana, Jueteadora, Coral, Bejuquilla, Mapaná de agua, Toche, Hicotea, Lobo pollero, Morrocoy

Spatial coverage

General spatial coverage: Colombia, Departamento Santander, Municipio Barrancabermeja, veredas Campo Galán y Campo Gala
Coordinates: 7°5'38.4''N and 7°6'32.4''N Latitude; 73°52'48''W and 73°52'37.2''W Longitude 

Temporal coverage: August 17, 2021 - December 15, 2021

Natural collections description

Parent collection identifier: IAvH
Collection name: Colección de Reptiles del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Collection identifier: IAvH-R
Specimen preservation method: Alcohol

Methods

Method step description: Una vez remitidos los especímenes a las instalaciones de las Colecciones Biológicas del Instituto Alexander von Humboldt, estos fueron lavados en agua, y transferidos a una solución preservante de Etanol al 70%. Posteriormente, se realizó la identificación y/o corroboración de la identidad taxonómica de los especímenes con base en literatura científica especializada y mediante la comparación con otros ejemplares de referencia ubicados en la Colección de Reptiles (IAvH-R). Estas determinaciones taxonómicas se realizaron hasta el nivel de especie. La taxonomía utilizada es de acuerdo a la propuesta en la plataforma ReptileDatabase (Uetz et al., 2021). Todos los ejemplares recolectados durante la salida de campo fueron depositados en la colección de reptiles (IAvH-R) del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. Los tejidos fueron catalogados con un código IAvH-CT y fueron depositados en la colección de tejidos del Instituto Humboldt (sede Palmira) en donde se mantendrán crioconservados a temperaturas entre -155°C y -170°C en tanques de nitrógeno líquido.

Para la digitalización y sistematización de los datos asociados a los registros, se realizó una validación geográfica de coordenadas del área de estudio, la cual incluyó corrección a nivel de vereda, municipio y departamento. Los datos fueron migrados a la base de datos de Specify mediante un formato tipo Darwin Core, con lenguaje controlado.
Study extent description: La Ecoreserva Refinería se encuentra ubicada en el municipio de Barrancabermeja, en el departamento de Santander y está constituida por tres predios que se conocen como Lote Rural, Lote La Esperanza y Granja La Esperanza ubicados en inmediaciones de la ciénaga y el caño San Silvestre, los predios están ubicados en las veredas Campo Gala y Campo Galán, y están cubiertos por agua casi en un 70%. La Ecoreserva comprende un total de 390 ha, con una elevación que varía entre los 50 y 100 m s.n.m. La fisionomía de sus ecosistemas son vegetación de crecimiento secundario , espejo de agua y vegetación flotante, así como también algunas plantaciones y cultivos transitorios y algunos pastizales de pastoreo.
Sampling description: Los muestreos de reptiles en la Ecoreserva Refinería se realizaron durante seis días netos, completando un esfuerzo de muestreo total de 180 horas/hombre. Estos se realizaron principalmente mediante el método libre de muestreo “Visual Encounter Survey” (VES), también conocido en español como Relevamiento por Muestreo Visual (REV). Se ejecutó este método que consiste en realizar transectos reportando y/o capturando todos los ejemplares encontrados, debido a que se ha demostrado que es el método más costo-efectivo para obtener un mayor número de ejemplares y de especies en muestreos de corta duración (Angulo et al. 2006). Durante los seis días netos de muestreo, se realizaron un total de 12 transectos repartidos entre seis recorridos diurnos y seis nocturnos. La longitud de los transectos varió entre 2.5 km y 5 km. El número de personas por muestreo varió entre tres y cuatro, así como también el esfuerzo de muestreo (horas/hombre) por recorrido, dependiendo por ejemplo si la investigadora principal del componente iba acompañada del equipo de sonidos y/o fotografía. Durante los transectos diurnos, se buscaron principalmente reptiles con comportamiento de forrajeo en horas del día e individuos escondidos en refugios como paleras y troncos podridos. Las jornadas diurnas se realizaron entre las 8:00 y 11:00 horas mientras que los recorridos nocturnos se hicieron entre las 17:30 y 23:00 horas. Sin embargo, estos tiempos de muestreo fueron susceptibles a cambios menores dependiendo, por ejemplo, de la cantidad de ejemplares pendientes por procesar. Los recorridos para muestrear en los sitios seleccionados en las veredas Campo Gala y Campo Galán se realizaron por lo general alrededor de senderos con cuerpos de aguas cercanos. Esto incluyó principalmente recorridos alrededor del Caño San Silvestre y Caño picho.

La búsqueda mediante el uso de VES fue complementada con métodos de remoción que consisten en utilizar herramientas como azadones, hachuelas y rastrillos para remover hojarasca, rocas móviles o troncos en descomposición, con el fin de encontrar especies que habitan o se refugian en estos microhábitats. Todos los individuos recolectados u observados fueron georreferenciados in situ utilizando un GPS GARMIN. Así mismo, se registró la mayor cantidad de datos ecológicos (comportamiento y microhábitat) asociados a los ejemplares recolectados y observados.

Se recolectó una submuestra (entre uno a tres individuos por especie) de la totalidad de individuos encontrados en campo.
Quality control description: Se realizó una validación geográfica de las coordenadas, a nivel de veredas, municipios y departamentos. Para la identificación taxonómica de los ejemplares, se consultaron artículos de revisión de los grupos de interés y/o artículos de la descripción original de la especie. En caso de ser necesario, también se valido la determinación taxonómica con ejemplares de referencia depositados en la colección. La sistematización de la información fue realizada mediante formato de migración tipo Darwin Core.

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Reptiles de la Ecoreserva Refinería (Santander, Barrancabermeja) - Proyecto FIBRAS
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/archive.do?r=reptiles_refineria-fibras_2022
Publication date of data: 2022-03-22
Language: Spanish
Licenses of use: Libre a nivel interno y externo (Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0)

External datasets

Dataset description
Object name: Reptiles de la Ecoreserva Refinería (Santander, Barrancabermeja) - Proyecto FIBRAS
Character encoding: utf-8
Format name: txt
Distribution: http://ipt.biodiversidad.co/iavh/resource?r=reptiles_refineria-fibras_2022

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2021-06-17
Hierarchy level: Dataset

References
Angulo, A., Rueda-Almonacid, J. V., Rodriguez-Mahecha, J. V., & Marca, E. (2006). Técnicas para el inventario y muestreo de anfibios: Una compilación. Técnicas de inventario y monitoreo para los anfibios de la región Tropical Andina (pp. 135–171). https://www.researchgate.net/publication/316238795_Tecnicas_para_el_inventario_y_muestreo_de_anfibios_Una_compilacion
Uetz, P., Freed, P. & Hošek, J. (eds.) (2021) The Reptile Database, http://www.reptile-database.org, accessed (septiembre 15, 2021). Electronic Database. http://reptile-database.org/