Registros biológicos georeferenciados de 234 plantas útiles de Colombia

Henry Agudelo Zamora1, Henry Darío Agudelo Zamora1, Infraestructura Institucional de Datos2, Carolina Castellanos Castro2, Henry Agudelo Zamora3, Mauricio Diazgranados Cadelo4

1 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá, D.C., Colombia; 2 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt, Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá, D.C., Colombia; 3 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt, Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá D.C, Colombia; 4 Royal Botanic Gardens Kew, , United Kingdom

Corresponding author(s): Henry Agudelo Zamora (hdagudelo@gmail.com)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Royal Botanic Gardens Kew (2021). Registros biológicos georeferenciados de 234 plantas útiles de Colombia. 234 registros. http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=rrbb_plantasutiles_colombia_2021 http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=rrbb_plantasutiles_colombia_2021

Abstract

I2D-BIO_2021_043. Conjunto de registros biológicos de 234 especies de plantas útiles consolidadas por el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt en el marco del proyecto Plantas y Hongos Útiles de Colombia. Las especies correspondan a aquellas para las cuales no se contaban con registros con coordenadas geográficas para el país en el portal GBIF.  Los georreferenciadas fueron consultados en el portal GBIF y portales nacionales de los herbarios COL, JBB y HUA, y posteriormente georeferenciados mediante el protocolo de Escobar et al. (2016). 

Keywords: Occurrence, Specimen, georreferenciación, plantas útiles, Colombia

General description

Purpose: Consolidar y georreferenciar al menos un registro biológico para 250 especies de plantas útiles identificadas por el Instituto en el marco del Acuerdo de Subsidio No. 20-010 y que no cuentan a la fecha con coordenadas para el país, a partir de la búsqueda de información en portales de biodiversidad en línea incluyendo herbarios virtuales nacionales e internacionales, siguiendo los parámetros definidos por el supervisor del contrato.

Project details

Project title: Plantas y Hongos Útiles de Colombia
Personnel: Carolina Castellanos Castro
Funding: Acuerdo de Subsidio No. 20-010 entre el Instituto Alexander von Humboldt y Royal Botanic Gardens Kew.
Contrato 21-20-010-116PS entre Henry Agudelo y el Instituto Alexander von Humboldt
Study area descriptions/descriptor: El presente recurso se enmarca en el Componente 1 del proyecto Plantas y Hongos Útiles de Colombia, el cual busca recopilar la información disponible sobre plantas y hongos y sus usos a nivel nacional.
Design description: El proyecto Plantas y Hongos Útiles de Colombia es una iniciativa de 2,5 años liderada por el Real Jardín Botánico de Kew con la colaboración del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. Su objetivo es desarrollar vías para mejorar la contribución de la naturaleza a la sociedad colombiana mediante el aumento, la consolidación y la accesibilidad del conocimiento sobre plantas y hongos útiles para el beneficio de todos, pero en especial de las comunidades locales. Adicionalmente, busca promover un mercado para especies nativas subutilizadas y sus productos de alto valor. Por último, el proyecto busca motivar el uso sostenible de la biodiversidad a la vez que se protegen los recursos naturales. 
El proyecto UPFC cuenta con el apoyo de un subsidio de Desarrollo Profesional y Compromiso a través del Fondo Newton-Caldas. El subsidio es financiado por el Departamento de Negocios, Energía y Estrategia Industrial del Reino Unido (BEIS) y el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación de Colombia (Minciencias), e implementado por el British Council

Data published through GBIF: http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=rrbb_plantasutiles_colombia_2021

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: 234 registros pertenecen al reino Plantae, de igual forma la totalidad de los registros pertenecen al filo Tracheophyta. De estos registros se tienen 5 clases, donde la que mayor número de registros tiene es la clase Magnoliopsida (158), así son registrados 37 ordenes, 88 familias, 194 géneros y 234 especies.
Taxonomic ranks
Species: especie

Spatial coverage

General spatial coverage: Los registros consolidados se localizan a lo largo del territorio colombiano.
Coordinates: 3°37'48''S and 12°32'24''N Latitude; 81°42'0''W and 68°8'24''W Longitude 

Temporal coverage: January 1, 1760 - March 6, 2019

Natural collections description

Parent collection identifier: No Aplica
Collection name: Herbario Nacional Colombiano (COL), United States National Herbarium (US), Herbarium Missouri Botanical Garden (MO), Naturalis, Herbario Real Jardín Botánico (MA), Herbarium Federico Medem (FMB), JBB, JBJCM-CV, Herbier National Muséum National d'Histoire Naturelle (P), Herbarium University of Michigan (MICH), Colección Viva del Jardín Botánico de la Universidad Nacional de Colombia-Sede Caribe- (JBSAI-UN), Royal Botanic Garden Edinburgh €, Botany  Carnegie Museum of Natural History, Herbario Universidad de Córdoba (HUC), Jardín Botánico Universidad Tecnológica de Pereira (JBUTP:COLVIVA), Coleção Botânica, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA), Herbario Nacional Departamento de Botánica Instituto de Biología Universidad Nacional Autónoma de México (MEXU), Herbario Universidad del Tolima (TOLI), Herbarium Universität Wien (WU), Herbário da Universidade de São Paulo - Coleção de Algas (SPF-ALGAE), Herbarium Aarhus University (Herbarium), William and Lynda Steere Herbarium The New York Botanical Garden (NY), Harvard University (AMES), HUA, Herbário Instituto de Botânica (SP), ICESI, UDBC, Jardim Botânico do Rio de Janeiro (RB), Herbarium, HPUJ, Herbarium Swedish Museum of Natural History (S)
Collection identifier: COL, US, MO, MA, FMB, JBB, P, MICH, E, INPA, TOLI, NY, WU, AMES, RB, HUA, SP, ICESI, MPUJ, S
Specimen preservation method: Dried and pressed

Methods

Method step description: Se realizó la consolidación de registros biológicos, a partir de la consulta del portal GBIF y otros portales de herbarios nacionales, de 250 plantas útiles consolidada en el marco del proyecto Plantas y Hongos Útiles de Colombia que no contaban con coordenadas geográficas en el país. La búsqueda fue realizada por medio del paquete “rgbif” (Chamberlain, 2017) en R versión 4.0.2 (R Core Team 2020) y RStudio versión 1.3.1073. Los registros fueron georreferenciadas mediante el protocolo de Escobar et al. (2016) asignando así un nivel de georreferencia, una incertidumbre y su posterior coordenada. De igual forma, se encontraron datos que necesitaban una modificación en la localidad ya que estos pertenecían a diferentes departamentos, estaban ubicados en otro lugar, habían errores de idioma en la localidad y en localidades antiguas la ubicación no correspondía con la información asociada al pliego.
Study extent description: Colombia
Sampling description: Consolidación y georreferenciación de registros biológicos de plantas útiles

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Registros biológicos georeferenciados de 234 plantas útiles de Colombia
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/archive.do?r=rrbb_plantasutiles_colombia_2021
Publication date of data: 2021-09-23
Language: Spanish
Licenses of use: Libre a nivel interno y externo (Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0)

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2021-08-31
Hierarchy level: Dataset

References
Chamberlain S., (2017). rgbif: Interface to the Global 'Biodiversity' Information Facility 'API'. R package version 0.9.8. https://CRAN.R-project.org/package=rgbif https://CRAN.R-project.org/package=rgbif
Escobar D., Jojoa L.M., Díaz S.R., Rudas E., Albarracín R.D., Ramírez C., Gómez J.Y., López C.R., Saavedra J., Ortiz R. (2016). Georreferenciación de localidades: Una guía de referencia para colecciones biológicas. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt – Instituto de Ciencias Naturales, Universidad Nacional de Colombia. Bogotá D.C., Colombia. 144 p.
R Core Team (2020). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. URL https://www.R-project.org/. https://www.R-project.org/