Registros biológicos de salamandras Neotropicales del género Bolitoglossa (Amphibia: Caudata: Plethodontidae)

Marco Antonio Rada Garcia1, Marco Antonio Rada Garcia2, Infraestructura Institucional de Datos2

1 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá, D.C., Colombia; 2 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Avenida Paseo Bolívar # 16-20, Bogotá, D.C., Colombia

Corresponding author(s): Marco Antonio Rada Garcia, Marco Antonio Rada Garcia (radamarco@gmail.com)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2014). Registros biológicos de salamandras Neotropicales del género Bolitoglossa (Amphibia: Caudata: Plethodontidae). http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=rrbb_salamadras_2022 http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=rrbb_salamadras_2022

Abstract

I2D-BIO_2022_062. Con 136 especies descritas, Bolitoglossa, familia Plethodontidae, es el género de salamandras con el mayor número de especies y rango de distribución conocido.  Su distribución se extiende desde el noreste de México hasta el norte y centro oeste de América del Sur (Colombia, Venezuela, Ecuador, Brasil, Peru y Bolivia). El conocimiento sobre las relaciones filogenéticas de las salamandras neotropicales del género Bolitoglossa ha aumentado considerablemente en los últimos 20 años. Sin embargo, aunque múltiples estudios han corroborado la monofilia de Bolitoglossa, las relaciones dentro del género y de este con otros clados de Plethodontidae – Subfamilia Hemidactyliinae – permanecen inciertas. Para Suramérica, análisis filogenéticos recientes muestran además un elevado grado de similitud morfológica entre las especies, pero una amplia variación en las distancias genéticas entre las diferentes poblaciones, por lo que la diversidad de especies en el género podría ser mayor a la actualmente reconocida. En este contexto, la porción norte de los Andes en Sudamérica registra la mayor cantidad de especies y endemismos, y por lo tanto la inclusión de esta diversidad en análisis filogenéticos es clave para entender la historia evolutiva del género. Sin embargo, la mayoría de estas especies no han sido incluidas en análisis filogenéticos cuantitativos usando evidencia molecular. Por lo tanto, el objetivo de la presente propuesta de investigación es poner a prueba las hipótesis de relaciones de parentesco de salamandras neotropicales del género Bolitoglossa mediante un análisis filogenético de parsimonia basado en evidencia molecular para 480 terminales, de los cuales 68 corresponden a especies colombianas. Los resultados de este análisis y el cálculo de distancias genéticas sirvieron para evaluar la diversidad de especies del género en el norte de los Andes en general, y en las cordilleras colombianas en particular. Para este fin, se usarán cinco marcadores moleculares ampliamente usados en estudios de diversificación filogenética de anfibios (fragmentos de genes mitocondriales y uno nuclear: RAG1, 12s, 16s, Cytb2, COI y 28s). 

El presente conjunto de datos contiene 68 registros documentados para 13 especies en el país.

Keywords: biodiversidad, taxonomía, Colombia, salamandras, Bolitoglossa, Occurrence, Especimen, Occurrence

General description

Purpose: El objetivo de la presente investigación es poner a prueba las hipótesis de relaciones de parentesco delas  salamandras neotropicales del género Bolitoglossa mediante un análisis filogenético basado en evidencia molecular (fragmentos de los genes mitocondriales y nucleares: 12s-16s, Cytb2, COI, 28s y RAG1). Los resultados de este análisis permitirán evaluar la diversidad de especies del género en el norte de los Andes en general, y en las cordilleras colombianas en particular. Para este fin, se usaron seis de los marcadores moleculares mas ampliamente usados en estudios de diversificación filogenética en los anfibios.

Project details

Project title: Plan Operativo Anual 2021
Personnel: Paola Pulido
Funding: Contrato No. 21-21-MADS-121PS entre Marco Rada y el Instituto Humboldt. Capes, FAPESP
Study area descriptions/descriptor: Salamandras Neotropicales del genero Bolitoglossa (distribuidas en Mexico hasta Bolivia) incluyendo a Colombia (Andes, Chocó y Amazonia).
Design description: PHYLOGENETIC RELATIONSHIPS OF THE NEOTROPICAL SALAMANDERS OF THE GENUS BOLITOGLOSSA (AMPHIBIA: CAUDATA: PLETHODONTIDAE). Con 136 especies descritas, Bolitoglossa, familia Plethodontidae, es el género de salamandras con el mayor número de especies y rango de distribución conocido.  Su distribución se extiende desde el noreste de México hasta el norte y centro oeste de América del Sur. El conocimiento sobre las relaciones filogenéticas de las salamandras neotropicales del género Bolitoglossa ha aumentado considerablemente en los últimos 20 años. Sin embargo, aunque múltiples estudios han corroborado la monofilia de Bolitoglossa, las relaciones dentro del género y de este con otros clados de Plethodontidae – Subfamilia Hemidactyliinae – permanecen inciertas. Para Suramérica, análisis filogenéticos recientes muestran además un elevado grado de similitud morfológica entre las especies, pero una amplia variación en las distancias genéticas entre las diferentes poblaciones, por lo que la diversidad de especies en el género podría ser mayor a la actualmente reconocida. En este contexto, la porción norte de los Andes en Sudamérica registra la mayor cantidad de especies y endemismos, y por lo tanto la inclusión de esta diversidad en análisis filogenéticos es clave para entender la historia evolutiva del género. Sin embargo, la mayoría de estas especies no han sido incluidas en análisis filogenéticos cuantitativos usando evidencia molecular. Por lo tanto, el objetivo de la presente propuesta de investigación es poner a prueba las hipótesis de relaciones de parentesco de salamandras neotropicales del género Bolitoglossa mediante un análisis filogenético basado en evidencia molecular. Los resultados de este análisis y el cálculo de distancias genéticas serán usados para evaluar la diversidad de especies del género en el norte de los Andes en general, y en las cordilleras colombianas en particular. Para este fin, se usarán cinco marcadores moleculares ampliamente usados en estudios de diversificación filogenética de anfibios (fragmentos de cuatro genes mitocondriales y uno nuclear).

Data published through GBIF: http://i2d.humboldt.org.co/resource?r=rrbb_salamadras_2022

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Salamandras del Género Biolitoglossa en Colombia que incluyen 68 registros documentados para 13 especies en el país.
Taxonomic ranks
Genus: Bolitoglossa
Common names: Salamandras

Spatial coverage

General spatial coverage: Salamandras del Género Biolitoglossa en Colombia que incluyen 68 registros documentados para 24 especies en el país.
Coordinates: 1°45'0''N and 11°40'12''N Latitude; 77°21'36''W and 73°5'60''W Longitude 

Temporal coverage: May 20, 1997 - May 15, 2020

Natural collections description

Parent collection identifier: No Aplica
Collection name: Museo Javeriano de Historia Natural; Zoologia; Colección de Prácticas Zoológicas Universidad del Valle;  Colección de Anfibios y Reptiles;
Collection identifier: MPUJ-ANFB; ICN-MHN; CPZ-UV; UV-C
Specimen preservation method: Formalin

Methods

Method step description: Muestreo taxonómico de las salamandras Neo-Tropicales del género Bolitoglossa en el Neo-Trópico (México-Bolivia) incluyendo a Colombia a partir de registros documentados de la diversidad del grupo y datos moleculares  (seis genes mitocondriales/nucleares: 12-16s, Cytb2, COI, RAG1 y 28s)  para 20 de las 24 especies de Bolitoglossa presentes en el país. Reconstrucción filogenética a partir de los accesos a bases de datos online como GenBank o generados en el marco de este proyecto de investigación (i.e., secuenciación Sanger, Alineamiento, y análisis filogenéticos de Parsimonia para establecer las relaciones de parentesco entre las especies).
Study extent description: Neo-trópico (México a Bolivia) En Colombia, el área de estudio incluyó el Chocó biogeográfico, los Andes y la Amazonia en el país).
Sampling description: Muestreo taxonómico de las salamandras Neo-Tropicales del género Bolitoglossa en Colombia a partir de registros documentados de la diversidad incluyendo datos moleculares para 20 de las 24 especies de Bolitoglossa presentes en el país.
Quality control description: Consulta de especialistas en el area de la herpetologia (p. ejemplo: Juan Manuel Daza (MHUA), Mauricio Rivera-Correa (ICN), John Douglas Lynch (ICN), Taran Grant (USP), Wilmar Bolivar (UV) y el creador de este recurso).

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Registros biológicos de salamandras Neotropicales del género Bolitoglossa (Amphibia: Caudata: Plethodontidae)
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: http://i2d.humboldt.org.co/archive.do?r=rrbb_salamadras_2022
Publication date of data: 2024-11-28
Language: Spanish
Licences of use: Libre a nivel interno y externo (Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0)

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2022-07-12
Hierarchy level: Dataset