Secuencias genéticas de Aves, Reptiles, Anfibios, Insectos, Plantas y Peces de expedición ColombiaBIO-Antioquia

María Claudia González1, Maria González1, Maria González2, Mailyn Gonzalez3, Paola Pulido1, Alejandro Lopera1, Alvaro Idárraga4, Andrés Acosta5, Cornelio Bota6, Francisco Roldan4, Humberto Mendoza5, Jose Aguilar5, Julian Aguirre7, Lina Mesa8, Socorro Sierra5, Infraestructura Institucional de Datos9

1 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Avenida Paseo Bolivar 16-20, Bogotá, D.C., Colombia; 2 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Avenida Paseo Bolivar 16-20, Bogotá, D.C., Colombia; 3 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt, Avenida Paseo Bolivar 16-20, Bogotá, D.C., Colombia; 4 , Colombia; 5 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Claustro de San Agustín- Carrera 8 No 15-08, Villa de Leyva, Colombia; 6 Universidad de Antioquia (UdeA), Medellín, Colombia; 7 Universidad Nacional de Colombia, Bogotá D.C, Colombia; 8 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Claustro de San Agustín- Carrera 8 No 15-08, Bogotá D.C, Colombia; 9 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt, Calle 28A No. 15-09, Bogotá, D.C., Colombia

Corresponding author(s): María Claudia González (mcgonzalezp@hotmail.com)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2017). Secuencias genéticas de Aves, Reptiles, Anfibios, Insectos, Plantas y Peces de expedición ColombiaBIO-Antioquia. 550 registros, aportados por: Gonzales, M. (Contacto del recurso), González, M. (Creador del recurso, Proveedor de metadatos). http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=secuencias_colombiabioantioquia_2017 http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=secuencias_colombiabioantioquia_2017

Abstract

I2D-BIO_2017_074.
Conjuntos de datos con los registros biológicos de las 550 secuencias para Aves, Reptiles, Anfibios, Insectos, Plantas y Peces, depositadas en la plataforma Barcode Of Life Datasystems (BOLD), del proyecto Colombia BIO, Expedición II – El Carmen de Viboral – Antioquia.

Keywords: Metadata, Colombia BIO, Antioquia, Carmen de Viboral, aves, peces, plantas, anfibios, reptiles, insectos, Specimen, Occurrence

General description

Purpose: Prestar los servicios profesionales para realizar la edición y depósito en la base de datos de códigos de barras de ADN pública BOLD Systems de secuencias genéticas de plantas, vertebrados e insectos recolectados en el marco del proyecto Colombia BIO.

Project details

Project title: Colombia BIO-Antioquia
Personnel: Mailyn Gonzalez
Funding: Fiduprevisora S.A. Convenio No. 16-062
Study area descriptions/descriptor: El Carmen de Viboral - Departamento de Antioquia, vereda "El Porvenir". por los ríos Melcocho, quebradas La Samaria y San Jose.
Design description: Generar código de barras de ADN de especies de plantas,vertebrados e insectos de muestras recolectadas en las expediciones biológicas del proyecto, lo cuál requiere la edición de las reacciones de secuencias genéticas y posterior publicación en la base de datos de código de barras de ADN pública BOLD Dystem

Data published through GBIF: http://i2d.humboldt.org.co/resource?r=secuencias_colombiabioantioquia_2017

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: 23 registros para anfibios
Taxonomic ranks
Class: Amphibia
Order: Anura, Gymnophiona

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: 52 registros para aves
Taxonomic ranks
Class: Aves
Order: Apodiformes, Passeriformes, Apodiformes

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: 285 registros para insectos,
Taxonomic ranks
Class: Insecta
Order: Odonata, Coleoptera, Diptera, Hymenoptera, Lepidoptera

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: 177 registros para plantas
Taxonomic ranks
Class: Liliopsida, Magnoliopsida, Polypodiidae, Pteridopsida

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: 6 registros para reptiles
Taxonomic ranks
Class: Reptilia
Order: Squamata

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: 7 registros para peces
Taxonomic ranks
Class: Actinopterygii
Order: Siluriformes, Characiformes, Cyprinodontiformes

Spatial coverage

General spatial coverage: Departamento de Antioquia,  en la Región del Carmen del Viboral
Coordinates: 5°50'60''N and 5°55'48''N Latitude; 75°11'24''W and 75°8'24''W Longitude 

Temporal coverage: August 15, 2016 - February 5, 2017

Natural collections description

Parent collection identifier: NA
Collection name: Colección de Tejidos del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Collection identifier: IAvH-CT
Specimen preservation method: Deep frozen

Methods

Method step description: Las secuencias para los diferentes grupos taxonómicos fueron editadas en el programa Geneious v. 9.0, posteriormente en la plataforma de BOLDSYSTEM (Barcode of lofe data system - http://v4.boldsystems.org) se creó un contaiber con el nombre "CBIHO Colombia BIO-IAvH" posteriormente se creó asoció un proyecto creado para cada grupo: 

Peces: CBIHS Fishes Colombia BIO-IAvH
Anfibios: CBIHA Amphibiens Colombia BIO-IAvH
Insectos: CBIHI Insects Colombia BIO-IAvH
Aves: CBIHB Birds Colombia BIO-IAvH
Insectos (Colectados con trampas malaise): CBIHM Malaise Colombia BIO-IAvH
Plantas: CBIHP Plants Colombia BIO-IAvH
Reptiles: CBIHR Reptiles Colombia BIO-IAvH

En cada uno de los proyectos se procedió a cargar las bases de datos de correspondiente a la información de las secuencias editadas.
Study extent description: El Carmen de Viboral - Departamento de Antioquia, vereda "El Porvenir". por los ríos Melcocho, quebradas La Samaria y San Jose.
Sampling description: En campo la mayoría de colectas se realizaron en recorridos libres, y los especímenes se colectaron a mano. Algunos insectos se colectaron con trampas malaise y redes. Para peces de emplearon redes, con aves se utilizaron redes de niebla. 

Los tejidos colectados se conservaron algunos en Sílica gel y otros en viales. Se encuentra conservados en el laboratorio de genética de la conservación del Instituto de Investigaciones Alexander von Humboldt.

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Secuencias genéticas de Aves, Reptiles, Anfibios, Insectos, Plantas y Peces de expedición ColombiaBIO-Antioquia
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: http://i2d.humboldt.org.co/archive.do?r=secuencias_colombiabioantioquia_2017
Publication date of data: 2024-11-28
Language: Spanish
Licences of use: Libre a nivel interno y externo (Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0)

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2017-11-21
Hierarchy level: Dataset