Registros biológicos

Secuencias genéticas de Aves, Reptiles, Anfibios, Insectos, Plantas y Peces de expedición ColombiaBIO-Antioquia

Última versión publicado el 28 de noviembre de 2024
I2D-BIO_2017_074. Conjuntos de datos con los registros biológicos de las 550 secuencias para Aves, Reptiles, Anfibios, Insectos, Plantas y Peces, depositadas en la plataforma Barcode Of Life Datasystems (BOLD), del proyecto Colombia BIO, Expedición II – El Carmen de Viboral – Antioquia.

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

Libre a nivel interno y externo (Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0)

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 550 registros.

también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

  • Occurrence (core)
    550
  • ResourceRelationship 
    1100

Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.

Descargas

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 550 registros en Español (40 kB) - Frecuencia de actualización: desconocido
Metadatos como un archivo EML descargar en Español (24 kB)
Metadatos como un archivo RTF descargar en Español (16 kB)

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2017). Secuencias genéticas de Aves, Reptiles, Anfibios, Insectos, Plantas y Peces de expedición ColombiaBIO-Antioquia. 550 registros, aportados por: Gonzales, M. (Contacto del recurso), González, M. (Creador del recurso, Proveedor de metadatos). http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=secuencias_colombiabioantioquia_2017

Palabras clave

Metadata; Colombia BIO; Antioquia; Carmen de Viboral; aves; peces; plantas; anfibios; reptiles; insectos; Specimen; Occurrence

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

María Claudia González
Contratista
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolivar 16-20
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Mailyn Adriana Gonzalez
Investigador Titular, Genética de la Conservación
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolivar 16-20
0000 Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C
CO
132027671166

¿Quién documentó los metadatos?:

Maria González
Contratista
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolivar 16-20
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Autor
Maria González
Contratista
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolivar 16-20
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C
CO
132027671166
Autor
Mailyn Gonzalez
Investigador Titular, Genética de la Conservación
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt
Avenida Paseo Bolivar 16-20
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
3202767
http://www.humboldt.org.co
Autor
Paola Pulido
Investigadora, Genética de la Conservación
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolivar 16-20
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
3202767
Autor
Alejandro Lopera
Investigador-contratista
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolivar 16-20
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
Autor
Alvaro Idárraga
Investigador
Autor
Andrés Acosta
Investigador
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Claustro de San Agustín- Carrera 8 No 15-08
Villa de Leyva
Boyacá
CO
Autor
Cornelio Bota
Investigador
Universidad de Antioquia (UdeA)
Medellín
Antioquia
CO
Autor
Francisco Roldan
Investigador
CO
Autor
Humberto Mendoza
Investigador
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Claustro de San Agustín- Carrera 8 No 15-08
Villa de Leyva
Boyacá
CO
Autor
Jose Aguilar
Investigador
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Claustro de San Agustín- Carrera 8 No 15-08
Villa de Leyva
Boyacá
CO
Autor
Julian Aguirre
Investigador
Universidad Nacional de Colombia
Bogotá D.C
Bogotá D.C
CO
Autor
Lina Mesa
Investigadora
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Claustro de San Agustín- Carrera 8 No 15-08
Bogotá D.C
Bogotá D.C
CO
Autor
Socorro Sierra
Investigadora
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Claustro de San Agustín- Carrera 8 No 15-08
Villa de Leyva
Boyacá
CO
Custodio de los Datos
Infraestructura Institucional de Datos
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt
Calle 28A No. 15-09
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
3202767
http://www.humboldt.org.co

Cobertura geográfica

Departamento de Antioquia, en la Región del Carmen del Viboral

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [5,85, -75,19], Latitud Máxima Longitud Máxima [5,93, -75,14]

Cobertura taxonómica

23 registros para anfibios

Class  Amphibia
Orden  Anura,  Gymnophiona

52 registros para aves

Class  Aves
Orden  Apodiformes,  Passeriformes,  Apodiformes

285 registros para insectos,

Class  Insecta
Orden  Odonata,  Coleoptera,  Diptera,  Hymenoptera,  Lepidoptera

177 registros para plantas

Class  Liliopsida,  Magnoliopsida,  Polypodiidae,  Pteridopsida

6 registros para reptiles

Class  Reptilia
Orden  Squamata

7 registros para peces

Class  Actinopterygii
Orden  Siluriformes,  Characiformes,  Cyprinodontiformes

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2016-08-15 / 2017-02-05

Datos del proyecto

No hay descripción disponible

Título Colombia BIO-Antioquia
Fuentes de Financiación Fiduprevisora S.A. Convenio No. 16-062
Descripción del área de estudio El Carmen de Viboral - Departamento de Antioquia, vereda "El Porvenir". por los ríos Melcocho, quebradas La Samaria y San Jose.
Descripción del diseño Generar código de barras de ADN de especies de plantas,vertebrados e insectos de muestras recolectadas en las expediciones biológicas del proyecto, lo cuál requiere la edición de las reacciones de secuencias genéticas y posterior publicación en la base de datos de código de barras de ADN pública BOLD Dystem

Personas asociadas al proyecto:

Investigador Principal
Mailyn Gonzalez

Métodos de muestreo

En campo la mayoría de colectas se realizaron en recorridos libres, y los especímenes se colectaron a mano. Algunos insectos se colectaron con trampas malaise y redes. Para peces de emplearon redes, con aves se utilizaron redes de niebla. Los tejidos colectados se conservaron algunos en Sílica gel y otros en viales. Se encuentra conservados en el laboratorio de genética de la conservación del Instituto de Investigaciones Alexander von Humboldt.

Área de Estudio El Carmen de Viboral - Departamento de Antioquia, vereda "El Porvenir". por los ríos Melcocho, quebradas La Samaria y San Jose.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Las secuencias para los diferentes grupos taxonómicos fueron editadas en el programa Geneious v. 9.0, posteriormente en la plataforma de BOLDSYSTEM (Barcode of lofe data system - http://v4.boldsystems.org) se creó un contaiber con el nombre "CBIHO Colombia BIO-IAvH" posteriormente se creó asoció un proyecto creado para cada grupo: Peces: CBIHS Fishes Colombia BIO-IAvH Anfibios: CBIHA Amphibiens Colombia BIO-IAvH Insectos: CBIHI Insects Colombia BIO-IAvH Aves: CBIHB Birds Colombia BIO-IAvH Insectos (Colectados con trampas malaise): CBIHM Malaise Colombia BIO-IAvH Plantas: CBIHP Plants Colombia BIO-IAvH Reptiles: CBIHR Reptiles Colombia BIO-IAvH En cada uno de los proyectos se procedió a cargar las bases de datos de correspondiente a la información de las secuencias editadas.

Datos de la colección

Nombre de la Colección Colección de Tejidos del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Identificador de la Colección IAvH-CT
Identificador de la Colección Parental NA
Métodos de preservación de los ejemplares Congelado

Metadatos adicionales

Propósito Prestar los servicios profesionales para realizar la edición y depósito en la base de datos de códigos de barras de ADN pública BOLD Systems de secuencias genéticas de plantas, vertebrados e insectos recolectados en el marco del proyecto Colombia BIO.
Identificadores alternativos http://i2d.humboldt.org.co/resource?r=secuencias_colombiabioantioquia_2017