Registros biológicos

Records of prioritized species of mammals of Colombia compiled from photo-trapping by the Instituto Humboldt.

Última versión publicado el 16 de febrero de 2023
I2D-BIO_2023_011. This dataset contains 126614 records and provides the most complete recompilation of records collected from the Instituto Humboldt based on photo-trapping data by 75 mammal species that are threatened, endemic or subject to use in Colombia between 2013 and 2022. The information increases the knowledge about this species, and it also provides comments or notes about the occurrences that support the records and strengthen the information so that it can be used in other processes such as the national risk assessment of the prioritized species.

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

Libre a nivel interno y externo (Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0)

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 126.614 registros.

también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

  • Occurrence (core)
    126614
  • MeasurementOrFacts 
    200000

Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.

Descargas

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 126.614 registros en Español (4 MB) - Frecuencia de actualización: cuando sea necesario
Metadatos como un archivo EML descargar en Inglés (22 kB)
Metadatos como un archivo RTF descargar en Inglés (15 kB)

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2023). Records of prioritized species of mammals of Colombia compiled from photo-trapping by the Instituto Humboldt. http://i2d.humboldt.org.co/resource?r=fototrampeo_endemicas-uso_iavh_2022

Palabras clave

ccurrence; camera trapping; Colombia; mammals; specimen; Specimen

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Cristian Alexander Cruz Rodríguez
Investigador Asistente II
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos, Alexander von Humboldt
Av. Circunvalar #16-20
Bogotá D. C.
Bogotá D. C.
CO
(+571) 320 2767
http://www.humboldt.org.co/

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Cristian Alexander Cruz-Rodríguez
Investigador Asistente II
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos, Alexander von Humboldt
Av. Circunvalar #16-20
Bogotá D. C.
Bogotá D. C.
CO
(+571) 320 2767
http://www.humboldt.org.co/

¿Quién documentó los metadatos?:

Cristian Alexander Cruz-Rodríguez
Investigador Asistente II
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos, Alexander von Humboldt
Av. Circunvalar #16-20
Bogotá D. C.
Bogotá D. C.
CO
(+571) 320 2767
http://www.humboldt.org.co/

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Custodio de los Datos
Infraestructura Institucional de Datos
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolívar # 16-20
110321 Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
3202767
http://www.humboldt.org.co
Autor
Angelica Diaz Pulido
Investigadora Adjunta
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolívar # 16-20
110321 Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
3202767
http://www.humboldt.org.co
Autor
Bibiana Gómez Valencia
Investigadora Adjunta
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolívar # 16-20
110321 Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
3202767
http://www.humboldt.org.co

Cobertura geográfica

The study area corresponds to continental area of Colombian territory, specifically reporting records for 821 localities distributed in 19 departments and 53 counties of the five natural regions of Colombia with exception to insular region (Archipelago of San Andrés and Providencia in the Caribbean Sea and Malpelo and Gorgona Islands in the Pacific Ocean).

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [1,134, -77,343], Latitud Máxima Longitud Máxima [11,226, -68,145]

Cobertura taxonómica

Records on 75 species of the class Mammalia, classified in 27 families and 10 orders (Ramírez-Chaves et al., 2016, 2021). The families with the highest number of recorded species were , Didelphidae (7 species), Felidae (6 species) and Cervidae (6 species). The families with the highest number of records were Dasyproctidae (38474 records), Cuniculidae (15878 records) and Didelphidae (12968 records). The most abundant species were Dasyprocta punctata (34822 records), Cuniculus paca (15312 records) and Didelphis marsupialis (9288 records). Designation to which ranks of taxa are reviewed with the current national list (Ramírez-Chaves et al., 2016, 2021) and validated with taxonomic national experts.

Orden  Artiodactyla (Venados),  Carnivora (Carnivoros),  Chiroptera (Chimbilás),  Cingulata (Armadillos),  Didelphimorphia (Chuchas),  Lagomorpha (Conejos),  Perissodactyla,  Pilosa (Peresozos, osos hormigueros),  Primates,  Rodentia (ratones, roedores)

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2013-10-17 / 2022-04-01

Datos del proyecto

To advance in the update of the red list of mammals in Colombia, the Humboldt Institute identified and consolidated biological records of mammal species obtained by camera traps between 2013 and 2022, following the DwC standard.

Título Records of prioritized species of mammals of Colombia, compiled from photo-trapping by the Humboldt Institute.
Identificador fototrampeo_endemicas-uso_iavh_2022
Descripción del área de estudio The study area comprises the national continental territory of Colombia. Specifically, it compiles records of 821 localities distributed in 53 municipalities and 19 departments.
Descripción del diseño The compilation of records of Colombian mammals through the use of camera traps is one of the Institute's contributions to the process of categorizing the mammals of Colombia. It also offers the opportunity to generate the most complete dataset for this group in the country obtained by photo-trapping.

Personas asociadas al proyecto:

Autor
Cristian Alexander Cruz Rodríguez
Autor
Angélica Paola Díaz Pulido
Autor
Bibiana Gómez Valencia
Autor
Elkin Alexi Noguera Urbano
Autor
Carolina Soto Vargas
Autor
Yenifer Herrera-Varón
Autor
Angélica Benítez
Autor
Federico Mosquera-Guerra
Autor
Laura Siabatto
Autor
Luis Fernando Cáceres Gómez
Autor
Luisa Fernanda Martinez Torres
Autor
Natalia Peña González
Autor
Olber Llanos Villegas
Autor
Gerlando Delgado Bermeo
Autor
Javier Garcia Villalba
Autor
Adriana Restrepo
Autor
Helena Olaya
Autor
José Manuel Ochoa Quintero

Métodos de muestreo

We systematized and standardized the photo-trapping data collected in different studies that had not been published for the last 9 years. Finally, the information received was grouped in a database in Darwin Core format.

Área de Estudio The information represents the effort to publish information to recognize the diversity of mammals and maintain their presence in the country to monitor changes in species over time and identify key sites for their conservation. For this purpose, camera-trap data obtained in different projects between 2013 and 2022 were collected in 712 localities in 20 departments.
Control de Calidad Scientific names were refined to be consistent with current taxonomy, based on literature on mammalian taxonomy and following the lists most updated species for the country (Ramírez-Chaves et al., 2016, 2021). Additionally, the databases were also refined, including only information at the species level, and with coordinates that were within the continental areas of Colombia, and corroborated under the standards of the BioModelos Program of the Instituto Humboldt (Velásquez-Tibatá et al., 2019).

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. A final data set of mammal species was obtained from the following procedure: 1. The information was organized following the Darwin Core standard for the documentation of biological records. 2. Names were validated according to Burgin et al. (2020) and for species not included there, information available in portals such as the IUCN Red List (https://www.iucnredlist.org/), and the most updated species lists for the country (Ramirez-Chaves et al., 2016, 2021) were followed. 3. For the validation of the geographic information, the routines of the BioModelos program were used and records with erroneous georeferencing were eliminated. The names of the departments and municipalities were also adjusted according to the Divipola data Portal. All data processing was carried out in the software R

Referencias bibliográficas

  1. Ramírez-Chaves, H. E., Suárez Castro, A.F., Sociedad Colombiana de Mastozoología, Zurc, D., Concha Osbahr, D. C., Trujillo, A., Noguera Urbano, E. A., Pantoja Peña, G. E., Rodríguez Posada, M. E., González Maya, J. F., Pérez Torres, J., Mantilla Meluk, H., López Castañeda, C., Velásquez Valencia, A., Zárrate Charry, D. (2021). Mamíferos de Colombia. Version 1.10. Sociedad Colombiana de Mastozoología. Checklist dataset https://doi.org/10.15472/kl1whs accessed via GBIF.org on 2021-03-16.
  2. Ramírez-Chaves, H. E., Suárez-Castro, A. F. & González-Maya, J. F. (2016). Cambios recientes a la lista de mamíferos de Colombia. Mammalogy Notes, 3(1), 1-9. https://doi.org/10.47603/manovol3n1.1-9.
  3. Velásquez-Tibatá, J., Olaya-Rodríguez, M. H., López-Lozano, D., Gutiérrez, C., González, I., & Londoño-Murcia, M. C. (2019). BioModelos: A collaborative online system to map species distributions. PLOS ONE, 14(3), e0214522. doi:10.1371/journal.pone.0214522 

Metadatos adicionales

Propósito This dataset compiles the most complete dataset on Colombian mammals obtained by photo-trapping. It is expected that the data included here will be useful for the management of the species reported, by providing valuable information regarding their occurrence.
Identificadores alternativos http://i2d.humboldt.org.co/resource?r=fototrampeo_endemicas-uso_iavh_2022