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Ecopetrol S.A., Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2022). Caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio - Proyecto FIBRAS. http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=hongos_piedemontemagdalena_2022
Keywords
aislamientos fúngicos; hongos cultivables; agua; suelo; sedimento; biodiversidad.; Occurrence
External data
The resource data is also available in other formats
| Caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio - Proyecto FIBRAS | https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=ecopetrol-fibras_hongos-piedemontemagdalena utf-8 txt |
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Contacts
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Geographic Coverage
Piedemonte, Casanare y Magdalena medio, Santander
| Bounding Coordinates | South West [5.053, -73.759], North East [6.88, -72.465] |
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Taxonomic Coverage
Se obtuvo un total de 202 registros biológicos de hongos (Fungi) distribuidos en 3 filos, Ascomycota representado por 15 órdenes, Basidiomycota representado por 4 órdenes y Mucoromycota representado por 1 orden . La taxonomía propuesta sigue lineamientos básicos en micología y se basa en guías de identificación, claves dicotómicas, libros, artículos científicos y fue complementada con información genética.
| Order | Amphisphaeriales, Botryosphaeriales, Chaetothyriales, Cladosporiales, Diaporthales, Eurotiales, Glomerellales, Helotiales, Hypocreales, Microascales, Pleosporales, Saccharomycetales, Sordariales, Venturiales, Xylariales, Cantharellales, Sporidiobolales, Trichosporonales, Ustilaginales, Mucorales |
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Temporal Coverage
| Start Date / End Date | 2021-03-14 / 2022-12-12 |
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Project Data
No Description available
| Title | Proyecto FIBRAS |
|---|---|
| Funding | Convenio FIBRAS, suscrito entre el Instituto Alexander von Humboldt (No. 19-155) y Ecopetrol S.A. (3025877) |
| Study Area Description | Este proyecto comprende áreas correspondientes a los departamentos del Huila, Casanare, Meta y la región del Magdalena Medio. En particular el componente 4b - Genómica, se enfocó en tres núcleos ubicados en los municipios de Neiva (Huila), Aguazul (Casanare), Tauramena (Casanare) , Barrancabermeja (Santander), El Carmen de Chucurí (Santander) y San Vicente de Chucurí. |
| Design Description | El proyecto FIBRAS es un acuerdo de cooperación para la planificación y gestión de la biodiversidad y sus contribuciones al bienestar para cinco áreas del territorio colombiano, bajo criterios de conservación y desarrollo sostenible basados en información científica. Como parte de este convenio surge la conformación de seis Ecoreservas, identificadas como áreas de propiedad de Ecopetrol destinadas en parte o completamente a la conservación de la biodiversidad y oferta de servicios ecosistémicos, sin limitar su vocación productiva. |
The personnel involved in the project:
Sampling Methods
En cada punto de muestreo se tomaron 3 réplicas en un transecto de 20 m y recogieron muestras de agua, suelo y sedimento.
| Study Extent | Piedemonte, Casanare y Magdalena medio, Santander |
|---|---|
| Quality Control | Durante el procesamiento de las muestras se pusieron controles de contaminación ambiental dejando cajas de Petri con agar papa dextrosa abiertas con el fin de registrar el crecimiento de hongos que estaban presentes en el ambiente durante el tiempo en el que se procesaron las muestras. |
Method step description:
- 1. Toma de las muestras en campo: Manteniendo condiciones de esterilidad se tomaron muestras de agua suelo y sedimento en cada uno de los puntos de muestreo. Las muestra colectadas fueron transportadas en cadena de frío hasta su procesamiento en el laboratorio.
- 2. Procesamiento de las muestras ambientales: 2.1. Aislamiento de los hongos: 2.1.1. Agua: Filtración al vacío para concentrar los propágulos contenidos en las muestras de agua. Los filtros obtenidos fueron depositados boca arriba en cajas de Petri con agar papa dextrosa. 2.1.2. Suelo y sedimento: Dilución y siembra en placa: Una muestra de suelo o sedimento (según corresponda), se suspendió en agua estéril y se procedió a diluir en una proporción de 1/10. Las diluciones 10e-1, 10e-3 y 10-5 se inocularon en cajas de agar papa dextrosa y agar rosa bengala por triplicado.
- 3. Purificación de los aislamientos en cultivos axénicos: Siguiendo las recomendaciones básicas de bioseguridad en laboratorios de microbiología, los hongos aislados fueron subcultivados en agar papa dextrosa hasta obtener cultivos axénicos, es decir, con un único hongo presente en el medio de cultivo.
- 4. Caracterización morfológica y genética de los aislamientos fúngicos: La caracterización morfológica se llevó a cabo a través de la descripción de rasgos micro y macroscópicos de cada aislamiento. Mientras la caracterización genética se llevó a cabo a través de la extracción de ADN, amplificación de uno o dos marcadores moleculares y la secuenciación de estos fragmentos por el método Sanger.
Collection Data
| Collection Name | Museo de Historia Natural C.J. Marinkelle-Universidad de los Andes |
|---|---|
| Collection Identifier | ANDES |
| Parent Collection Identifier | ANDES |
| Specimen preservation methods | Other |
|---|
Additional Metadata
| Purpose | Aunar esfuerzos técnicos, administrativos y financieros entre el Instituto Alexander von Humboldt y la Universidad de los Andes para caracterizar la diversidad funcional de hongos y realizar la caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables de las muestras ambientales, definidas por el supervisor del convenio por parte del Instituto, en el marco del Convenio No. 19-155 suscrito entre el Instituto Alexander von Humboldt y Ecopetrol S.A. |
|---|---|
| Alternative Identifiers | http://i2d.humboldt.org.co/resource?r=hongos_piedemontemagdalena_2022 |