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Registros
Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 202 registros.
Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.
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Versiones
La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.
¿Cómo referenciar?
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Ecopetrol S.A., Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2022). Caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio - Proyecto FIBRAS. http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=hongos_piedemontemagdalena_2022
Palabras clave
aislamientos fúngicos; hongos cultivables; agua; suelo; sedimento; biodiversidad.; Occurrence
Datos externos
Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos
| Caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio - Proyecto FIBRAS | https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=ecopetrol-fibras_hongos-piedemontemagdalena utf-8 txt |
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Contactos
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Cobertura geográfica
Piedemonte, Casanare y Magdalena medio, Santander
| Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [5,053, -73,759], Latitud Máxima Longitud Máxima [6,88, -72,465] |
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Cobertura taxonómica
Se obtuvo un total de 202 registros biológicos de hongos (Fungi) distribuidos en 3 filos, Ascomycota representado por 15 órdenes, Basidiomycota representado por 4 órdenes y Mucoromycota representado por 1 orden . La taxonomía propuesta sigue lineamientos básicos en micología y se basa en guías de identificación, claves dicotómicas, libros, artículos científicos y fue complementada con información genética.
| Orden | Amphisphaeriales, Botryosphaeriales, Chaetothyriales, Cladosporiales, Diaporthales, Eurotiales, Glomerellales, Helotiales, Hypocreales, Microascales, Pleosporales, Saccharomycetales, Sordariales, Venturiales, Xylariales, Cantharellales, Sporidiobolales, Trichosporonales, Ustilaginales, Mucorales |
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Cobertura temporal
| Fecha Inicial / Fecha Final | 2021-03-14 / 2022-12-12 |
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Datos del proyecto
No hay descripción disponible
| Título | Proyecto FIBRAS |
|---|---|
| Fuentes de Financiación | Convenio FIBRAS, suscrito entre el Instituto Alexander von Humboldt (No. 19-155) y Ecopetrol S.A. (3025877) |
| Descripción del área de estudio | Este proyecto comprende áreas correspondientes a los departamentos del Huila, Casanare, Meta y la región del Magdalena Medio. En particular el componente 4b - Genómica, se enfocó en tres núcleos ubicados en los municipios de Neiva (Huila), Aguazul (Casanare), Tauramena (Casanare) , Barrancabermeja (Santander), El Carmen de Chucurí (Santander) y San Vicente de Chucurí. |
| Descripción del diseño | El proyecto FIBRAS es un acuerdo de cooperación para la planificación y gestión de la biodiversidad y sus contribuciones al bienestar para cinco áreas del territorio colombiano, bajo criterios de conservación y desarrollo sostenible basados en información científica. Como parte de este convenio surge la conformación de seis Ecoreservas, identificadas como áreas de propiedad de Ecopetrol destinadas en parte o completamente a la conservación de la biodiversidad y oferta de servicios ecosistémicos, sin limitar su vocación productiva. |
Personas asociadas al proyecto:
Métodos de muestreo
En cada punto de muestreo se tomaron 3 réplicas en un transecto de 20 m y recogieron muestras de agua, suelo y sedimento.
| Área de Estudio | Piedemonte, Casanare y Magdalena medio, Santander |
|---|---|
| Control de Calidad | Durante el procesamiento de las muestras se pusieron controles de contaminación ambiental dejando cajas de Petri con agar papa dextrosa abiertas con el fin de registrar el crecimiento de hongos que estaban presentes en el ambiente durante el tiempo en el que se procesaron las muestras. |
Descripción de la metodología paso a paso:
- 1. Toma de las muestras en campo: Manteniendo condiciones de esterilidad se tomaron muestras de agua suelo y sedimento en cada uno de los puntos de muestreo. Las muestra colectadas fueron transportadas en cadena de frío hasta su procesamiento en el laboratorio.
- 2. Procesamiento de las muestras ambientales: 2.1. Aislamiento de los hongos: 2.1.1. Agua: Filtración al vacío para concentrar los propágulos contenidos en las muestras de agua. Los filtros obtenidos fueron depositados boca arriba en cajas de Petri con agar papa dextrosa. 2.1.2. Suelo y sedimento: Dilución y siembra en placa: Una muestra de suelo o sedimento (según corresponda), se suspendió en agua estéril y se procedió a diluir en una proporción de 1/10. Las diluciones 10e-1, 10e-3 y 10-5 se inocularon en cajas de agar papa dextrosa y agar rosa bengala por triplicado.
- 3. Purificación de los aislamientos en cultivos axénicos: Siguiendo las recomendaciones básicas de bioseguridad en laboratorios de microbiología, los hongos aislados fueron subcultivados en agar papa dextrosa hasta obtener cultivos axénicos, es decir, con un único hongo presente en el medio de cultivo.
- 4. Caracterización morfológica y genética de los aislamientos fúngicos: La caracterización morfológica se llevó a cabo a través de la descripción de rasgos micro y macroscópicos de cada aislamiento. Mientras la caracterización genética se llevó a cabo a través de la extracción de ADN, amplificación de uno o dos marcadores moleculares y la secuenciación de estos fragmentos por el método Sanger.
Datos de la colección
| Nombre de la Colección | Museo de Historia Natural C.J. Marinkelle-Universidad de los Andes |
|---|---|
| Identificador de la Colección | ANDES |
| Identificador de la Colección Parental | ANDES |
| Métodos de preservación de los ejemplares | Otro |
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Metadatos adicionales
| Propósito | Aunar esfuerzos técnicos, administrativos y financieros entre el Instituto Alexander von Humboldt y la Universidad de los Andes para caracterizar la diversidad funcional de hongos y realizar la caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables de las muestras ambientales, definidas por el supervisor del convenio por parte del Instituto, en el marco del Convenio No. 19-155 suscrito entre el Instituto Alexander von Humboldt y Ecopetrol S.A. |
|---|---|
| Identificadores alternativos | http://i2d.humboldt.org.co/resource?r=hongos_piedemontemagdalena_2022 |