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Data Records
The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 696 records.
1 extension data tables also exist. An extension record supplies extra information about a core record. The number of records in each extension data table is illustrated below.
- Occurrence (core)
- ResourceRelationship
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How to cite
Researchers should cite this work as follows:
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2018). Secuencias genéticas de Aves, Reptiles, Hongos, Peces, Anfibios y Plantas de la expedición ColombiaBIO-Chingaza (Medina-San Juanito). 696 registros, aportados por: Gonzalez, M.A. (Contacto del recurso), González, M.C (Creador del recurso, Proveedor de metadatos). http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=secuencias_colombiabiovichada_2017
Keywords
ColombiaBIO; aves; peces; reptiles; anfibios; insectos; malaise; plantas; hongos; Vichada; Puerto Carreño; BOLD System; Specimen; Occurrence; Occurrence
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Geographic Coverage
El proyecto se llevó a cabo en el Departamento del Vichada en los municipios de Puerto Carreño y Cumaribo
| Bounding Coordinates | South West [5.514, -68.683], North East [5.889, -68.327] |
|---|
Taxonomic Coverage
32 registros para anfibios, los 32 identificados a nivel de especie
| Class | Amphibia |
|---|---|
| Order | Anura |
114 registros para aves, de los cuales 108 registros identificados a nivel de especie, 5 a género y 1 a familia
| Class | Aves |
|---|---|
| Order | Accipitriformes, Apodiformes, Caprimulgiformes, Charadriiformes, Columbiformes, Coraciiformes, Cuculiformes, Galbuliformes, Passeriformes, Piciformes |
19 registros para mamíferos, de los cuales 14 se identificaron a nivel de especie y 5 a nivel de género
| Class | Mammalia |
|---|---|
| Order | Chiroptera, Rodentia |
10 registros para Reptiles identificados todos a nivel de especie
| Class | Reptilia |
|---|---|
| Order | Squamata, Eusuchia |
479 registros para insectos, colectados en trampas malaise. 263 se identificados a nivel de especie 16 a género, 199 a nivel de familia y 1 subespecie
| Order | Coleoptera, Diptera, Hemiptera, Hymenoptera |
|---|---|
| Subfamily | Psocoptera |
103 registros para peces, 99 identificados a nivel de especie y 4 nivel de género
| Class | Actinopterygii, Elasmobranchii |
|---|---|
| Order | Myliobatiformes, Cichliformes, Clupeiformes, Perciformes, Siluriformes |
| Subfamily | Characiformes |
185 registros para plantas, de los cuales 152 se identificaron a nivel de especie, 25 a género y 8 a familia
| Domain | Boraginales |
|---|---|
| Class | Liliopsida, Magnoliopsida |
| Order | Alismatales, Aquifoliales, Arecales, Aristolochiales, Asparagales, Asterales, Caryophyllales, Celastrales, Commelinales, Dilleniales, Dioscoreales, Ericales, Fabales, Gentianales, Lamiales, Laurales, Liliales, Magnoniales, Malpighiales, Malvales, Oxalidales, Piperles, Poales, Polypodiales, Proteales, Santalales, Sapindales, Solanales, Vitales, Zingiberales |
32 registros para hongos. 3 identificados a nivel de especie, 17 a nivel de género, 10 a familia y 2 a orden
| Class | Sordariomycetes, Agaricomycetes |
|---|---|
| Order | Agaricales, Hymenochaetales, Polyporales, Xylariales |
Temporal Coverage
| Start Date / End Date | 2017-03-31 / 2017-04-07 |
|---|
Project Data
No Description available
| Title | Colombia BIO |
|---|---|
| Funding | Fiduprevisora S.A. Convenio No. 16-062 |
| Study Area Description | Departamento de Vichada. Municipios Puerto Carreño y Cumaribo |
| Design Description | Generar código de barras de ADN de especies de plantas, hongos,vertebrados e insectos de muestras recolectadas en las expediciones biológicas del proyecto, lo cuál requiere la edición de las reacciones de secuencias genéticas y posterior publicación en la base de datos de código de barras de ADN pública BOLD System |
The personnel involved in the project:
Sampling Methods
En campo la mayoría de colectas se realizaron en recorridos libres. Los insectos se colectaron con trampas malaise y redes. Para peces de emplearon redes, con aves se utilizaron redes de niebla. Para plantas se colectaron tejidos foliares. Los tejidos colectados se conservaron algunos en Sílica gel y otros en viales. Se encuentran conservados en el laboratorio de genética de la conservación del Instituto de Investigaciones Alexander von Humboldt.
| Study Extent | Departamento de Vichada. Municipios Puerto Carreño y Cumaribo |
|---|
Method step description:
- Las secuencias para los diferentes grupos taxonómicos fueron editadas en el programa Geneious v. 9.0, posteriormente se cargaron en la plataforma de BOLDSYSTEM (Barcode of lofe data system - http://v4.boldsystems.org) se creó un contaiber con el nombre "CBIHO Colombia BIO-IAvH" posteriormente se creó asoció un proyecto creado para cada grupo: Peces: CBIHS Fishes Colombia BIO-IAvH Hongos: CBIHF Fungi Colombia BIO-IAvH Anfibios: CBIHA Amphibiens Colombia BIO-IAvH Aves: CBIHB Birds Colombia BIO-IAvH Insectos (Colectados con trampas malaise): CBIHM Malaise Colombia BIO-IAvH Plantas: CBIHP Plants Colombia BIO-IAvH Reptiles: CBIHR Reptiles Colombia BIO-IAvH
Collection Data
| Collection Name | Colección de Tejidos del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt |
|---|---|
| Collection Identifier | IAvH-CT |
| Parent Collection Identifier | NA |
| Specimen preservation methods | Deep frozen |
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Additional Metadata
| Alternative Identifiers | http://i2d.humboldt.org.co/resource?r=secuencias_colombiabiovichada_2017 |
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