Registros biológicos

Secuencias genéticas de Aves, Hongos, Reptiles, Anfibios, Plantas y Peces, de la expedición Colombia BIO–Vichada

Última versión publicado el 28 de noviembre de 2024
I2D-BIO_2018_054. Conjuntos de datos con los registros biológicos de 696 secuencias de los siguientes grupos taxonómicos: Aves, Hongos, Reptiles, Anfibios, Plantas y Peces, depositadas en la plataforma Barcode Of Life Datasystems (BOLD), del proyecto Colombia BIO, Expedición III – Vichada

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

Libre a nivel interno y externo (Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0)

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 696 registros.

también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

  • Occurrence (core)
    696
  • ResourceRelationship 
    696

Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.

Descargas

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 696 registros en Español (45 kB) - Frecuencia de actualización: desconocido
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Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2018). Secuencias genéticas de Aves, Reptiles, Hongos, Peces, Anfibios y Plantas de la expedición ColombiaBIO-Chingaza (Medina-San Juanito). 696 registros, aportados por: Gonzalez, M.A. (Contacto del recurso), González, M.C (Creador del recurso, Proveedor de metadatos). http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=secuencias_colombiabiovichada_2017

Palabras clave

ColombiaBIO; aves; peces; reptiles; anfibios; insectos; malaise; plantas; hongos; Vichada; Puerto Carreño; BOLD System; Specimen; Occurrence; Occurrence

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

María Claudia González
Contratista
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolivar 16-20
110141 Bogota, D.C.
Bogota, D.C.
CO
3015198182

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Mailyn Adriana Gonzalez
Investigador Titular, Genética de la Conservación
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolivar 16-20
110141 Bogota, D.C.
Bogota, D.C.
CO
(57) 1 320 2767

¿Quién documentó los metadatos?:

María Claudia Gonzalez
Contratista
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolivar 16-20
110141 Bogota, D.C.
Bogota, D.C.
CO
3015198182

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Proveedor de Contenido
María Claudia Gonzalez
Contratista
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolivar 16-20
110141 Bogota, D.C.
Bogota, D.C.
CO
3015198182
Autor
Mailyn Gonzalez
Investigador Titular, Genética de la Conservación
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolivar 16-20
110141 Bogota, D.C.
Bogota, D.C.
CO
(57) 1 320 2767
Autor
Eduardo Tovar
Laboratorio Genética de la Conservación
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Sede Palmira (CIAT)
Cali
Valle del Cauca
(57) 2 4450174
Custodio de los Datos
Infraestructura Institucional de Datos
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt
Calle 28A No. 15-09
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
3202767
http://www.humboldt.org.co

Cobertura geográfica

El proyecto se llevó a cabo en el Departamento del Vichada en los municipios de Puerto Carreño y Cumaribo

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [5,514, -68,683], Latitud Máxima Longitud Máxima [5,889, -68,327]

Cobertura taxonómica

32 registros para anfibios, los 32 identificados a nivel de especie

Class  Amphibia
Orden  Anura

114 registros para aves, de los cuales 108 registros identificados a nivel de especie, 5 a género y 1 a familia

Class  Aves
Orden  Accipitriformes,  Apodiformes,  Caprimulgiformes,  Charadriiformes,  Columbiformes,  Coraciiformes,  Cuculiformes,  Galbuliformes,  Passeriformes,  Piciformes

19 registros para mamíferos, de los cuales 14 se identificaron a nivel de especie y 5 a nivel de género

Class  Mammalia
Orden  Chiroptera,  Rodentia

10 registros para Reptiles identificados todos a nivel de especie

Class  Reptilia
Orden  Squamata,  Eusuchia

479 registros para insectos, colectados en trampas malaise. 263 se identificados a nivel de especie 16 a género, 199 a nivel de familia y 1 subespecie

Orden  Coleoptera,  Diptera,  Hemiptera,  Hymenoptera
Subfamilia  Psocoptera

103 registros para peces, 99 identificados a nivel de especie y 4 nivel de género

Class  Actinopterygii,  Elasmobranchii
Orden  Myliobatiformes,  Cichliformes,  Clupeiformes,  Perciformes,  Siluriformes
Subfamilia  Characiformes

185 registros para plantas, de los cuales 152 se identificaron a nivel de especie, 25 a género y 8 a familia

Dominio  Boraginales
Class  Liliopsida,  Magnoliopsida
Orden  Alismatales,  Aquifoliales,  Arecales,  Aristolochiales,  Asparagales,  Asterales,  Caryophyllales,  Celastrales,  Commelinales,  Dilleniales,  Dioscoreales,  Ericales,  Fabales,  Gentianales,  Lamiales,  Laurales,  Liliales,  Magnoniales,  Malpighiales,  Malvales,  Oxalidales,  Piperles,  Poales,  Polypodiales,  Proteales,  Santalales,  Sapindales,  Solanales,  Vitales,  Zingiberales

32 registros para hongos. 3 identificados a nivel de especie, 17 a nivel de género, 10 a familia y 2 a orden

Class  Sordariomycetes,  Agaricomycetes
Orden  Agaricales,  Hymenochaetales,  Polyporales,  Xylariales

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2017-03-31 / 2017-04-07

Datos del proyecto

No hay descripción disponible

Título Colombia BIO
Fuentes de Financiación Fiduprevisora S.A. Convenio No. 16-062
Descripción del área de estudio Departamento de Vichada. Municipios Puerto Carreño y Cumaribo
Descripción del diseño Generar código de barras de ADN de especies de plantas, hongos,vertebrados e insectos de muestras recolectadas en las expediciones biológicas del proyecto, lo cuál requiere la edición de las reacciones de secuencias genéticas y posterior publicación en la base de datos de código de barras de ADN pública BOLD System

Personas asociadas al proyecto:

Investigador Principal
Mailyn Gonzalez

Métodos de muestreo

En campo la mayoría de colectas se realizaron en recorridos libres. Los insectos se colectaron con trampas malaise y redes. Para peces de emplearon redes, con aves se utilizaron redes de niebla. Para plantas se colectaron tejidos foliares. Los tejidos colectados se conservaron algunos en Sílica gel y otros en viales. Se encuentran conservados en el laboratorio de genética de la conservación del Instituto de Investigaciones Alexander von Humboldt.

Área de Estudio Departamento de Vichada. Municipios Puerto Carreño y Cumaribo

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Las secuencias para los diferentes grupos taxonómicos fueron editadas en el programa Geneious v. 9.0, posteriormente se cargaron en la plataforma de BOLDSYSTEM (Barcode of lofe data system - http://v4.boldsystems.org) se creó un contaiber con el nombre "CBIHO Colombia BIO-IAvH" posteriormente se creó asoció un proyecto creado para cada grupo: Peces: CBIHS Fishes Colombia BIO-IAvH Hongos: CBIHF Fungi Colombia BIO-IAvH Anfibios: CBIHA Amphibiens Colombia BIO-IAvH Aves: CBIHB Birds Colombia BIO-IAvH Insectos (Colectados con trampas malaise): CBIHM Malaise Colombia BIO-IAvH Plantas: CBIHP Plants Colombia BIO-IAvH Reptiles: CBIHR Reptiles Colombia BIO-IAvH

Datos de la colección

Nombre de la Colección Colección de Tejidos del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Identificador de la Colección IAvH-CT
Identificador de la Colección Parental NA
Métodos de preservación de los ejemplares Congelado

Metadatos adicionales