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Registros
Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 192 registros.
Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.
Descargas
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Versiones
La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.
¿Cómo referenciar?
Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:
Ecopetrol S.A., Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2022). Microorganismos aislados de áreas para las conservación en Orinoquía y Magdalena medio del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio - Proyecto FIBRAS. http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=hongos_piedemontemagdalena_2022
Palabras clave
bacterias; caracterización fenotípica; caracterización molecular; hidrocarbonoclastas; 16s.; Occurrence; Metadata; Specimen
Datos externos
Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos
| Caracterización taxonómica y genética de bacterias cultivables del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio - Proyecto FIBRAS | https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=ecopetrol-fibras_microorganismos-piedemontemagdalena utf-8 txt |
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Contactos
¿Quién creó el recurso?:
¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:
¿Quién documentó los metadatos?:
¿Quién más está asociado con el recurso?:
Cobertura geográfica
Zona de Magdalena medio en Santander (7°04′03″N 73°50′50″W) y Piedemonte llanero en Casanare (5°10′08″N, 72°32′48″W)
| Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [5,131, -73,758], Latitud Máxima Longitud Máxima [6,88, -72,394] |
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Cobertura taxonómica
Se obtuvo un total de 192 registros biológicos de bacterias distribuidos en 33 Familias, 30 generos . La taxonomía se basó en los resultados obtenidos a partir de Silva; y para cada grupo a nivel genérico se emplearon claves o artículos científicos de Referencia.
| Orden | Bacillales, Brevibacillales, Burkholderiales, Caulobacterales, Enterobacterales, Lactobacillales, Micrococcales, Paenibacillales, Propionibacteriales, Pseudomonadales, Rhizobiales, Rhodobacterales, Sphingomonadales, Staphylococales, Streptomycetales, Xanthomonadales |
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Cobertura temporal
| Fecha Inicial / Fecha Final | 2021-03-14 / 2022-01-27 |
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Datos del proyecto
No hay descripción disponible
| Título | Proyecto FIBRAS |
|---|---|
| Fuentes de Financiación | Convenio FIBRAS, suscrito entre el Instituto Alexander von Humboldt (No. 19-155) y Ecopetrol S.A. (3025877) |
| Descripción del área de estudio | Este proyecto comprende áreas correspondientes a los departamentos del Huila, Casanare, Meta y la región del Magdalena Medio. En particular el componente 4b - Genómica, se enfocó en tres núcleos ubicados en los municipios de Neiva (Huila), Aguazul (Casanare), Tauramena (Casanare) , Barrancabermeja (Santander), El Carmen de Chucurí (Santander) y San Vicente de Chucurí. |
| Descripción del diseño | El proyecto FIBRAS es un acuerdo de cooperación para la planificación y gestión de la biodiversidad y sus contribuciones al bienestar para cinco áreas del territorio colombiano, bajo criterios de conservación y desarrollo sostenible basados en información científica. Como parte de este convenio surge la conformación de seis Ecoreservas, identificadas como áreas de propiedad de Ecopetrol destinadas en parte o completamente a la conservación de la biodiversidad y oferta de servicios ecosistémicos, sin limitar su vocación productiva. |
Personas asociadas al proyecto:
Métodos de muestreo
En el Magdalena medio se muestrearon 12 puntos y en el Casanare 9 puntos. En cada punto de muestreo se tomaron 3 réplicas en un transecto de 20 m y recogieron muestras de agua, suelo y sedimento.
| Área de Estudio | Dentro de la región del Magdalena medio en el municipio de Barrancabermeja y en Aguazul en el departamento de Casanare dentro del Piedemonte Llanero. |
|---|---|
| Control de Calidad | Todas las muestras y procedimientos para el aislamiento y caracterización se realizaron bajo un modelo de investigación por triplicado. Además, para cada paso se aplicaron blancos o pruebas sin tratamientos para corroborar la inocuidad y éxito metodológico en campo y dentro del laboratorio. |
Descripción de la metodología paso a paso:
- 1. Toma de las muestras en campo: Manteniendo condiciones de esterilidad se tomaron muestras de agua suelo y sedimento en cada uno de los puntos de muestreo. Las muestra colectadas fueron transportadas en cadena de frío hasta su procesamiento en el laboratorio. 2. Procesamiento de las muestras ambientales: 2.1. Aislamiento de bacterias: 2.1.1. Suelo y sedimento: Dilución y siembra en placa: Una muestra de suelo o sedimento (según corresponda), se suspendió en agua estéril y se procedió a diluir en una proporción de 1/10. Las diluciones 10e-1, 10e-3 y 10-5 se inocularon en cajas de agar R2A (0.5x). 3. Purificación de los aislamientos en cultivos axénicos: Siguiendo las recomendaciones básicas de bioseguridad en laboratorios de microbiología, las bacterias aisladas fueron aisladas de forma individual posterior a la confirmación de las características de colonia y celular. Se usaron medios generales de cultivo (R2A y TSB) y medios basales enriquecidos con crudo al 1%, para el aislamiento y caracterización de bacterias con potencial hidrocarbonoclasta. 4. Una vez se logró la corroboración de las características fenotípicas se procedió a los análisis moleculares para todos los aislamientos. La caracterización molecular para las bacterias se realizó a través de: la extracción de ADN ; amplificación del gen ribosomal 16s; la secuenciación por el método Sanger y la identificación taxonómica con Silva.
Datos de la colección
| Nombre de la Colección | Colección de recursos biológicos Universidad EAFIT |
|---|---|
| Identificador de la Colección | 227 |
| Identificador de la Colección Parental | EAFIT |
| Métodos de preservación de los ejemplares | Congelado |
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Metadatos adicionales
| Propósito | Aunar esfuerzos técnicos, administrativos y financieros entre el Instituto Alexander von Humboldt y la Universidad de los Andes para caracterizar la diversidad funcional de hongos y realizar la caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables de las muestras ambientales, definidas por el supervisor del convenio por parte del Instituto, en el marco del Convenio No. 19-155 suscrito entre el Instituto Alexander von Humboldt y Ecopetrol S.A. |
|---|---|
| Identificadores alternativos | http://i2d.humboldt.org.co/resource?r=microrganismos_piedemontemagdalena_2022 |